اگزوزوم های خارج سلولی و پره اکلامپسی : یک مطالعه مبتنی برداده های ریز آرایه و تحلیل عملکرد

مقدمه : پره اکلامپسی یک بیماری هتروژنوس در دوره بارداری می باشد که پاتوفیزیولوژی دقیق آن مشخص نیست .امروزه اگزوزوم ها به عنوان یکی از عوامل دخیل در پاتوژنز این بیماری مطرح شده اند. اهداف از مطالعه کنونی جستجو در کتابخانه های ریزآرایه و انجام تحلیل عملکرد بر روی ژن های استخراج شده برای پیش بینی نقش آنها در پاتوژنز پره اکلامپسی بود. روش کار: داده های ریز آرایه gse10588 توسط geo2r و نرم افزار r نسخه4 تحلیل شدند. تجزیه و تحلیل اجزای اصلی (principal component analysis: pca ) برای بررسی نرمال بودن داده ها انجام شد. تحلیل عملکرد توسط enrichr و david 6.8 و   panther 16 انجام گرفت. یافته ها : تحلیل داده های ریز آرایه نشان داد که ژن های lep، or8g2 و dst با میزان بیان log2fc>4، افزایش معنادار و ژن های ptch1 و znf598 با میزان log2fc<-3، کاهش معناداری در جفت زنان مبتلا به پره اکلامپسی دارند. تحلیل اجزای سلولی نشان داد که بیشترین تعداد ژن های استخراج شده مرتبط با اگزوزوم خارج سلولی می باشد. بعلاوه پاسخ به هیپوکسی ، اتصال سلول به سلول ، تکامل مغز و متابولیسم گالاکتوز مسیرهای استخراج شده هستند.نتیجه گیری : نتایج این مطالعه نشان داد که اگزوزوم خارج سلولی، پاسخ به هیپوکسی و متابولیسم گالاکتوز به طور معناداری با پره اکلامپسی مرتبط بوده و می توانند به عنوان شاخص های پیش آگهی پره اکلامپسی به کار گرفته شوند.

extracellular exosomes and preeclampsia: a microarray-based study and functional enrichment analysis

background: preeclampsia (pe) is a heterogeneous pregnancy disease which the exact pathophysiology of it is unknown. recently exosomes have been indicated as a causative factor in the pathogenesis of pe. the aim of the study was to investigate in microarray library data to extract the differentially expressed genes (degs) in pe and to perform a functional enrichment analysis to predict the role of degs in pathogenesis of pe. materials and methods: gse10588 microarray library data was analyzes by geo2r and r package (version 4.1.0). principal component analysis (pca) was performed to analyze the normality of the data. annotation analysis was performed by enrichr, david 6.8 and panther 16. results: microarray data analysis showed that lep, or8g2 and dst genes had the highest expression and ptch1 and znf598 genes had the lowest expression in placenta of preeclamtic women. cellular component analysis showed that most of the extracted genes are related to extracellular exosome. in addition, response to hypoxia, cell-cell adhesion, brain development and galactose metabolism are the pathways that enriched. conclusion: extracellular exosome, response to hypoxia and galactose metabolism need more attention and investigation in pe.