|
|
|
|
انتقال دهنده پلی آمین atp13a2 و کووید 19: یک مطالعه مبتنی برداده های ریز آرایه وآنالیز عملکرد
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
علیپور محسن ,روستازاده اباذر
|
|
منبع
|
مجله علوم پزشكي پارس - 1400 - دوره : 19 - شماره : 3 - صفحه:14 -19
|
|
چکیده
|
مقدمه : پاندمی کووید 19 عده کثیری را مبتلا نموده و متاسفانه موجب مرگ و میر بسیاری نیز شده است. مکانیسم دقیق عمل ویروس عامل آن در بدن مشخص نیست. هدف از مطالعه کنونی بررسی و آنالیز داده های ریز آرایه و بررسی عملکرد بود تا بتوانیم به مکانیسم های جدید نحوه عملکرد این ویروس در سلول های انسان دست یابیم.روش کار: داده های ریزآرایه استخراج شده از ncbi توسط geo2r و نرم افزار r مورد آنالیز قرار گرفت. ژن هایی که افزایش بیان و کاهش بیان داشتند استخراج شدند و سپس آنالیز عملکرد در مورد آنها صورت گرفت .یافته ها : . نتایج نشان داد که در سطح لگاریتم پایه دو تغییر بیان بزرگتر از 3 و کوچکتر از 3- ترانس کریپتوم، 319 و 573 ژن افزایش بیان یافته به ترتیب در گروه بیماران کووید خفیف و کووید شدید وجود دارند. همچنین 156 و 590 ژن کاهش بیان یافته به ترتیب در گروه بیماران کووید خفیف و کووید شدید وجود دارند. نتایج go نشان داد که الگوی ژن های تفاوت بیان یافته در گروه بیماران کووید با فرم شدید با ژن atp13a2 مرتبط است.نتیجه گیری : ویروس کووید 19 احتمالا در تعامل با عواملی چون atp13a2 شرایط بقای خود در داخل سلول را تنظیم می نماید.
|
|
کلیدواژه
|
کووید 19، ریز آرایه، آنالیز عملکرد، atp13a2
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی جهرم, گروه بیوشیمی، گروه علوم و فناوری های نوین پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی جهرم, مرکز تحقیقات بیماری های غیرواگیر, گروه بیوشیمی، گروه علوم و فناوری های نوین پزشکی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
roustazadeh@jums.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
polyamine transporter atp13a2 and covid-19: a microarray assay-based and functional analysis study
|
|
|
|
|
Authors
|
alipour mohsen ,roustazadeh abazar
|
|
Abstract
|
introduction: unfortunately, a lot of people infected with and died due to covid-19. the exact mechanism of causative virus in human body is unknown. the aims of the study were to survey and analysis the microarray data and to perform functional analysis to unveil the new mechanisms of this virus in regarding to human cells.methods: ncbi microarray extracted data were analyzed by geo2r and r package. up- and down-regulated genes were extracted and functional analysis was performed.results: results showed that in log of expression greater than 3 and lesser than -3 of transcriptome, there were 319 and 573 up-regulated genes in mild and severe covid-19 patients, respectively. also there were 156 and 590 down-regulated genes in mild and severe covid-19 patients, respectively. go analysis showed that deferentially expressed gene pattern in severe covid-19 patients is related to atp13a2conclusion: covid-19 probably regulates its vitality in human cells through interplay with factors such as atp13a2
|
|
Keywords
|
atp13a2
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|