تعیین فراوانی آللی و ژنوتایپی ژن vkorc1 در جمعیت شهر بیرجند

مقدمه: استفاده از وارفارین به عنوان رایج‌ترین ضد انعقاد خوراکی همواره با محدودیت هایی همراه است. اثر این داروی ضد انعقاد به دلیل عوامل فارماکودینامیک، فارماکوکینتیک و خصوصاً عوامل فارماکوژنتیک به طور گسترده ای در بین بیماران متغیر است. پلی ‌مورفیسم‌ های ژن vkorc1 یکی از فاکتورهای ژنتیکی موثر در تعیین دوزاژ این دارو می باشد. این تحقیق به منظور عملکرد بهتر در تعیین دوز اختصاصی دارو برای هر فرد و با هدف تعیین فراوانی آللی و ژنوتایپی ژن vkorc1، در شهر بیرجند انجام گرفت.روش‌ها: 115 نفر از افرادی که برای آزمایش هایpt وinr به بیمارستان های امام رضا(ع) و ولیعصر(عج) شهر بیرجند مراجعه کردند، برای این مطالعه ‌ی تجربی انتخاب شدند. پس از استخراج dnaی ژنومیک، تمامی قطعات تکثیر شده ‌ی vkorc1، تعیین توالی شده و ژنوتیپ آنها مشخص گردید. آنالیز آماری توسط نرم افزار spss صورت گرفت.یافته ‌ها: میانگین سنی بیماران 12.9 ± 57.7 سال بود و از این میان 55 نفر زن و 60 نفر مرد بودند. فراوانی ژنوتیپ های نرمال، هتروزیگوت و هموزیگوت جهش‌ یافته واریانتg>a 1639 از ژن vkorc1 در مردان 3.40%، 5.30% ،5.17% و در زنان 50%، 7.36%، 5% بدست آمد. برای واریانت c>t1173 فراوانی ژنوتیپ های نرمال، هتروزیگوت و هموزیگوت جهش یافته در مردان 9.38%، 9.38% و 2% و در زنان 52.6%، 40.4%، 7% بودند. دو جهش جدید g.3660g>a و g.3565g>t با فراوانی به ترتیب 2.7% و 0.9% در ناحیه پروموتر g>a1639 مشاهده شد. در نهایت آلل هایg 1639 و c1173 در جمعیت بیرجند دارای فراوانی بالایی (68.1% و 62.6%) بودند.نتیجه‌ گیری: یافته های ما نشان می دهد تفاوت های قابل توجهی در فراوانی واریانت های ژنتیکی vkorc1 در جمعیت شهر بیرجند در مقایسه با سایر نقاط ایران وجود دارد که ناشی از تفاوت های قومیتی بوده و در تعیین حساسیت به دارو بسیار تاثیرگذار هستند. با توجه به این تفاوت های ژنتیکی، اطلاع از ژنوتیپ بیماران قبل ازشروع درمان با وارفارین به داشتن درمانی دقیق و کارآمد کمک خواهد کرد.

Allele and genotype frequencies of VKORC1 in Birjand population

Introduction: Administration of warfarin, the most common oral anticoagulant, is usually accompanied with limitations. Anticoagulant effect of warfarin has wide interpatients variations due to pharmacodynamics, pharmacokinetics and especially pharmacogenetics factors. Polymorphisms of VKORC1 gene is one of the genetic factors influencing adjustment of warfarin dosage. In order to better determine the appropriate dosage of the drug, this study was conducted to find out the allele and genotype frequencies of VKORC1 gene in population of Birjand city.Methods: One hundredfifteen patients who referred to Imam Reza and Valiasr hospitals of Birjand city for PT and INR tests, were selected for this experimental study. After genomic DNA extraction, all amplified PCR products of VKORC1 were sequenced to determine the genotypes. Statistical analysis was performed using SPSS software.Results: The average age of patients was 57.7 ± 12.9, 55 were women and 60 were men. Normal, heterozygous and homozygous mutant genotypes of 1639 G>A variant, had a frequency of 40.3%, 30.5%, 17.5% in men; and 50%, 36.7%, 5% in women, respectively. Regarding 1173C>T variant, normal, heterozygous and homozygous mutant genotypes had a frequency of 38.9%, 38.9%, 22.2% in men; and 52.6%, 40.4%, 7% in women, respectively. Two new mutations as g.3660G> A and g.3565G> T with the frequency of 2.7% and 0.9% in 1639 G>A promoter region of VKORC1 gene were observed. Finally, 1639G and 1173C alleles had a high frequency (68.1% and 62.6%, respectively) in people of Birjand city.Conclusion: Our results indicate that there are significant differences in the frequency of VKORC1 genetic variants in people of Birjand city compared to other parts of Iran. The ethnic differences can affect sensitivity to warfarin. Therefore, knowing the genotype of the patients before starting warfarin therapy will help to have a precise and efficient therapy.