بررسی آلاینده‌های میکروبی در اسپان قارچ دکمه‌ای سفید (agaricus bisporus) با استفاده از راهکار متاژنومیکس

تولید قارچ مدلی از اقتصاد چرخشی است. از محصولات جانبی کشاورزی مانند کلش گندم و کود مرغ برای تولید مواد غنی از پروتئین و مواد مغذی استفاده می‌‏شود. مهم‌ترین قارچ خوراکی agaricus bisporus است که عموماً به‌عنوان قارچ دکمه‌ای شناخته می‌شود. در طول فرایند تولید a. bisporus، انواع باکتری‌ها و قارچ‌ها درگیر هستند. وجود آلودگی‌های باکتریایی و قارچی در اسپان قارچ می‌تواند منجر به تلفات اقتصادی قابل‌توجه و ایجاد بیماری‌های مضر در قارچ شود. پیشرفت‌های اخیر از جمله متاژنومیکس نقش مهمی در شناخت باکتری‌ها و قارچ‌های اصلی آلوده‌کننده اسپان قارچ، بهبود بهره‌وری و کاهش بیماری‌های قارچی دارد. در این مطالعه، آلودگی اسپان قارچ با استفاده از تکثیر ژن  16s rrna و توالی‌یابی نواحی (its) و همچنین آنالیز متاژنومیکس مورد تجزیه ‌و تحلیل قرار گرفت. داده‌ها به واحدهای طبقه‌بندی عملیاتی (otus) دسته‌بندی شدند. شایع‌ترین آلودگی باکتریایی و قارچی به‌ترتیب توسط باسیلوس و پنی‌سیلیوم ایجاد شد. به‌دست‌آوردن درک جامعی از بیمارگر‌های قارچ منجر به افزایش عملکرد و کیفیت قارچ می‌شود. این مطالعه، با استفاده از تکنیک‌های متاژنومیکس، جامعه قارچی و باکتریایی موجود در اسپان قارچ در طول کشت مشخص شد. همچنین روش‌های استریل‌سازی موثر برای حذف آلاینده‌های دانه‌های غلات مورد استفاده برای تولید اسپان بررسی و نتایج تحلیل شد.

unveiling microbial contaminants in agaricus bisporus mushroom spawns using metagenomics approach

mushroom production is a practical circular economy model, leveraging agricultural by-products like wheat straw and chicken manure to yield nutrient-dense, protein-enriched foods. the edible mushroom is agaricus bisporus, commonly known as the button mushroom. throughout the production process of a. bisporus, a variety of bacteria and fungi are involved. the presence of bacterial and fungal contamination in mushroom spawn can lead to substantial economic losses and the development of harmful diseases in the mushrooms. recent advancements in metagenomics have played a crucial role in identifying the main bacteria and fungi present in mushroom spawn. in this study, the contamination of mushroom spawn was analyzed using 16s rrna and internal transcribed spacer sequencing. the data was classified into operational taxonomic units.  the most frequent bacterial contamination was caused by bacillus, while penicillium was the most common fungal contaminant. gaining a comprehensive understanding of the biocontrol of mushroom pathogens has the potential to enhance mushroom yield and quality. this study, utilizing metabarcoding techniques, reveals the fungal and bacterial community present in mushroom spawn during cropping. it also highlights the importance of effective sterilization procedures to eliminate contaminants from cereal grains used for spawn production.