شناسایی، کلونینگ، خالص‌سازی و تعیین عملکرد آنزیم نوترکیب زایلاناز برگرفته از نمونه متاژنومی شکمبه گاو

طیور مانند بسیاری از حیوانات از آنزیم‌ها برای هضم غذا استفاده می‌کنند. آنزیم‌ها مهمترین مواد افزودنی در صنعت تولید خوراک حیوانی محسوب شده و موجب بهبود هضم غذا می‌شوند. از سوی دیگر، پیش‌تیمار خوراک طیور با آنزیم زایلاناز موجب بالا رفتن ارزش غذایی و افزایش هضم غذا در سیستم گوارش حیوان می‌شود. در این مطالعه با استفاده از روش‌های محاسباتی بیوانفورماتیکی از داده‌های متاژنومی شکمبه گاو یک ژن مقاوم به حرارت زایلاناز با استفاده از نرم‌افزار taxyl شناسایی و persixyn9 نامگذاری شد و به‌منظور تعیین کارکرد آنزیمی تحت بررسی‌های آزمایشگاهی قرار گرفت. ژن زایلاناز موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی از دی.ان.ای متاژنومی جداسازی و در وکتور بیانی مناسب کلون شد و سپس بیان و خالص‌سازی آنزیم مذکور انجام شد. بررسی پارامترهای بیوشیمیایی در خصوص این آنزیم نشان داد که بهینه فعالیت آن در دمای ℃50 بوده و از طرفی ph بهینه فعالیت آن نیز 6 است. شاخص‌های بیوشیمیایی km و vmax برای این آنزیم به‌ترتیب برابر 1/22mg/ml و 206/78μmol min-1 mg-1 محاسبه شد. تصاویر مربوط به میکروسکوپ الکترونی روبشی ‌(sem) از فعالیت این آنزیم بر روی خوراک طیور در دمای ℃50 کارایی بالای این آنزیم را به‌عنوان افزودنی در صنعت خوراک طیور نشان داد.

identification, cloning, purification and activity determination of a recombinant xylanase enzyme identified from bovine rumen metagenome

poultry, like many animals, uses enzymes for the digestion of feed. to overcome the undesirable effects of deleterious factors and improve digestion of feed, enzymes are used as supplements infeed formulation. supplementation of feed with definite enzymes enhances its nutritive value, thereby increasing the effectiveness of digestion. enzymes are the most important and useful additives in the animal feed industry. xylanases are widely used in the animal feed industry. pretreatment of animal feed with xylanases increases the nutritional value and digestion in ruminants. in this study, metagenomic data of bovine rumen were explored and then a thermostable xylanase gene was identified using taxyl software and named persixyn9. the laboratory tests were carried out to determine the enzymatic activity. protein expression was done in e. coli (bl21) and a nickel column was used for protein purification. the biochemical parameters of the enzyme showed the optimal activity at 50℃, and the optimum ph of 6. kinetic values, km and vmax, for this enzyme were calculated to be 1.18 mg/ml and 206.78 μmol min-1mg-1 respectively. scanning electron microscopy (sem) images of the activity of the enzyme on poultry feed at 50℃ represent the high efficiency of the xylanase as an additive in the poultry feed industry.