آشنایی با نرم‌افزار gmoseek به‌منظور شناسایی و بررسی موجودات تراریخته

با توجه به سرعت فزاینده تایید و تجاری ‌سازی محصولات تراریخته در سراسر جهان، آزمایش‌ های مربوط به شناسایی این محصولات در غذا، علوفه و نمونه ‌های بذری با توجه به مقررات مربوط، بسیار مشکل و هزینه‌ بر خواهد بود. بسیاری از روش ‌های تشخیصی در حال حاضر با توجه به بودجه محدود متناسب با منابع در دسترس، برای افزایش بهره ‌وری از نرم‌افزارهای مبتنی بر جدول ماتریسی از داده ‌ها رویکرد ماتریسی استفاده می ‌نمایند. در بسیاری از مواقع رویکرد ماتریسی با استفاده از ابزار محاسباتی خاص و اطلاعات بسیار اندک، در جهت استفاده کارآمد از داده ‌های موجود قابل اجرا است. نرم ‌افزار توسعه ‌یافته gmoseek برای پشتیبانی از تصمیم ‌گیری ‌های انجام شده در تمامی مراحل آزمایش ‌های تشخیص موجودات تراریخته، از جمله تفسیر نتایج خام آزمایشگاهی طراحی شده است. این نرم‌افزار از جدول ماتریسی رخداد (event) و عناصر ژنتیکی مربوط به آن ها و اطلاعات موجود در مورد نمونه استفاده می ‌کند. این ابزار با استفاده از استراتژی بهینه ‌سازی، روش ‌های غربالگری مناسب‌ تری برای نمونه پیشنهاد می ‌دهد. در ادامه، نرم‌افزار gmoseek اجازه می ‌دهد تا کاربر به دلخواه به جستجوی ترکیب مقرون به صرفه‌ای از تست‌ های غربالگری بر روی نمونه خاص تراریخته بپردازد. بعلاوه این نرم‌ افزار به کاربر امکان انتخاب تجزیه و تحلیل مناسب برای تعیین حضور یک رخداد به خصوص در نمونه مورد بررسی را می ‌دهد.

Study of GMOseek software in order to detection of genetically modified organisms

Due to the increasing speed of approval and commercialization of GM crops around the world, matching tests for food, feed and seed samples according to relevant regulations will be very difficult and very expensive. Many of them have already adopted the so called ldquo;matrix approach rdquo; to rationalize the resources and efforts used to increase their efficiency within a limited budget. Most of the time, the ldquo;matrix approach rdquo; is implemented using limited information and some proprietary computational tool to efficiently use the available data. The tool makes use of a tabulated matrix of GM events and their genetic elements, of the laboratory analysis history and the available information about the sample at hand. The tool uses an optimization approach to suggest the most suited screening assays for the given sample. The practical GMOseek user interface allows the user to customize the search for a costefficient combination of screening assays to be employed on a given sample. It further guides the user to select appropriate analyses to determine the presence of individual GM events in the analyzed sample.