تاریخچه شناسایی مولکولی پوتی‌ویروس‌ها

پوتی ویروس ها یکی از بزرگترین خانواده ویروس های گیاهی (potyviridae) با بیشترین اهمیت اقتصادی هستند. پوتی ویروس ها دارای پیکره ی رشته ای، خمش پذیر و ساختار ژنومی آر.ان.ای تک رشته ای با قطبیت مثبت هستند و 183 گونه دارند. امروزه از سنجش های بیولوژیکی، سرولوژیکی و مولکولی برای غربالگری پوتی ویروس ها استفاده می شود. این مقاله کاربرد روش های مختلف مربوط به شناسایی پوتی ویروس هایی که در ایران و جهان باعث ایجاد آلودگی طیف وسیعی از گیاهان می شوند، مرور می شود. استفاده از آغازگرها به خصوص آغازگرهای دژنره نه تنها ردیابی سریع پوتی ویروس ها را تسهیل کرده بلکه توالی یابی قسمتی از ژنوم و تاکسونومی این ویروس ها را نیز امکان پذیر ساخته است. امروزه سیستم taqman توسعه یافته و می تواند تعداد نسخه های اولیه آر.ان.ای پوتی یروس ها را در گیاهان آلوده نسبت به گیاهان سالم نشان دهد. فناوری ترانسکریپتوم واکنش های پیچیده بین پروتئین های چندمنظوره ی پوتی ویروس ها و ارتباط آنها با پروتئین های میزبان را نشان می دهد. این روش در تشخیص پاسخ های مولکولی و فیزیولوژیکی گیاه آلوده به پوتی ویروس ها و همچنین تکامل و فیلوژنی آنها نقش دارد. فناوری کریسپر یکی از روش های موثر و جدید ویرایش هدفمند ژنوم است که در جهت ارتقای کیفیت و عملکرد گیاهان و ایجاد صفات جدید در آنها استفاده می شود. از این روش می توان برای تولید گیاهان مقاوم به پوتی ویروس ها استفاده کرد.

History of molecular identification of Potyviruses

Potyviruses are one of the largest families of plant viruses (Potyviridae) with the most economic importance. Potyviruses have flexuous filaments and the genome consists of a positive sense single stranded RNA with 183 species. Today, biological, serological, and molecular assays are used to screen potyviruses. In this review, the application of different methods is described to the identification of potyviruses that are infected with a wide range of plants in Iran and the world. The use of primers, especially degenerate primers, has not only facilitated the rapid detection of potyviruses but also the sequencing of a part of the genome also makes the taxonomy of these viruses possible. Today, the TaqMan system has been developed and can show the number of early RNA copies of potyviruses in infected plants compared to healthy plants. Transcriptome technology demonstrates complex reactions between putative multifunctional proteins and their association with host proteins. This method is involved in the detection of molecular and physiological responses of infected plants with potyviruses as well as their evolution and phylogeny. CRISPR technology is one of the effective and novel methods for purposeful editing of the genome that is used to improve the quality and yield of plants and create new characteristics in them. This method can be used to produce resistant plants to potyviruses.