تغییرات جهشی ویروس کرونا در جایگاه rbd در شرایط همه‌گیری جهانی، یک مطالعه مروری

تعداد جهش‌های اتفاق افتاده در عامل بیماری covid19 مکانیسم‌های درمان و پیشگیری را با مشکل مواجهه نموده است. بنابراین تعیین ماهیت و علل جهش‌های ایجادشده و پیش‌بینی جهش‌های احتمالی آینده از اولویت‌های تحقیقاتی بشمار می‌روند. ازاین‌رو، هدف این مقاله مروری بررسی یافته‌های علمی منتشرشده در خصوص جهش‌های ژنوم s به‌ویژه در ناحیه rbd و پیش‌بینی جهش‌های احتمالی آینده بود. نتایج بررسی ما نشان داد که عامل کووید 19 ویروسی تک‌رشته‌ای از خانواده کرونا ویریده دارای rna تک‌رشته‌ای با طول ژنوم حدود bp 29881 است (genbank no mn908947). ژنوم این ویروس 9860 اسیدآمینه را رمز می‌کند که شامل قطعات ژنی، پروتئین‌های ساختاری و غیر ساختاری است. ژن‌های s، e، m و n وظیفه رمز کردن پروتئین‌های ساختاری را بر عهده‌دارند و پروتئین‌های غیر ساختاری، شامل nsp و orf می‌باشند. ظهور این بیماری باعث اتخاذ استراتژی‌های نو برای تشخیص و درمان و تولید واکسن شد. عدم موفقیت روش‌های مدیریت درمان بیماری به دلیل وقوع جهش‌های متعدد در ژنوم covid19 بوده است. بیشترین جهش‌ها در پروتئین s ویروس گزارش‌شده است. در گلیکوپروتیین s جایگاهی به نام receptor-binding domain (rbd) وجود دارد که از طریق آن ویروس به گیرنده خود متصل می‌شود. تغییرات در این ناحیه مسئولیت اصلی اتصال به گیرنده (ace2) angiotensin-converting enzyme 2 را به عهده دارد. درنتیجه نقش اساسی در ایجاد واریانت های جدید را به خود اختصاص داده و عامل اصلی در انتشار ویروس است. شناخت جهش‌های ثبت‌شده در این قسمت از ویروس اثرات زیادی بر دانش ما داشته است. علاوه بر آن، با انجام آنالیز این جهش‌ها احتمالاً بتوان تغییرات ژنومی آینده ویروس را پیش‌بینی کرد.

Changes in Receptor Binding Domain of the Covid-19 during Pandemic; a Review Study

The number of mutations that have caused Covid19 disease has hampered treatment and prevention mechanisms. Therefore, determining the nature and causes of the mutations created and predicting possible future mutations are among the research priorities. Therefore, the purpose of this article was to review the published scientific findings regarding mutations in the S genome, especially in the RBD region, and to predict possible future mutations. The results of our study showed that Covid factor 19 is a singlestranded virus from the corona viridae family with singlestranded RNA with a genome length of about 29881 bp (GenBank no MN908947). The virus genome encodes 9860 amino acids, which include gene fragments, structural and nonstructural proteins. The S, E, M, and N genes are responsible for encoding structural proteins, and nonstructural proteins include nsp and ORF. The emergence of this disease led to the adoption of new strategies for the diagnosis, treatment and production of vaccines. The failure of disease management methods has been due to the occurrence of multiple mutations in the Covid19 genome. Most mutations in the S protein of the virus have been reported. In glycoprotein S, there is a site called the ReceptorBinding Domain (RBD) through which the virus attaches to its receptor. Changes in this region are primarily responsible for binding to the ACE2 receptor (Angiotensinconverting enzyme 2) receptor; therefore, it plays a key role in the development of new variants and is a major factor in the spread of the virus. Understanding the mutations in this part of the virus has had a profound effect on our knowledge. In addition, by analyzing these mutations, it is possible to predict future genomic changes in the virus.Author Contribution: All Author contributed equally in this work.Conflict of Interest/Funding/Supports: The author state that have no conflict of interest/funding/supports in this study.Ethical Considerations: All ethical concerns respected in this study.Applicable Remarks: To help for finding proper management strategies during covid19 pandemic.