اولین گزارش از ردیابی و شناسایی بیمارگرهای فیتوپلاسمایی مرتبط با برخی از گیاهان زینتی شهر یزد

در بازدیدهای بهار و تابستان سال 1402 از نمونه‌‌های گیاهی فضای سبز و گلخانه‌‌های زینتی و علف‌‌های هرز همجوار این گیاهان در شهر یزد، نشانه های مشکوک به بیماری فیتوپلاسمایی مانند کتابی‌‌شدن ساقه، ریزبرگی و زردی مرتبط با گیاهان سنبل‌‌ختایی، برگ‌‌نو، لاله عباسی و کنف‌‌وحشی دیده شد. از هر گیاه 5 نمونه جمع‌‌آوری و به مرکز تحقیقات ویروس‌‌شناسی گیاهی دانشگاه شیراز منتقل شد. استخراج دی.ان.ای. به روش ctab انجام شد و واکنش زنجیره‌‌ای پلی‌‌مراز با آغازگرهای عمومی (p1 / p7) و آغازگرهای آشیانه‌‌ای (r16mf2 / r16mr2) فیتوپلاسماها صورت پذیرفت. برابر انتظار در پی.سی.آر. با آغازگرهای عمومی و آشیانه‌‌ای قطعاتی به‌‌ترتیب به اندازه‌‌ی 1800 و 1250 جفت‌‌باز تکثیر شد. قطعات حاصل از تکثیر پی.سی.آر. حاصل از آغازگرهای r16mf2 / r16mr2 از ژل برش یافته و بعد از خالص‌‌سازی جهت تعیین ترادف دوطرفه به شرکت سینوهه ارسال شدند. مقایسه توالی‌‌های به‌‌دست آمده با توالی‌‌های موجود درncbi  توسط نرم‌‌افزارblast  نشان داد که فیتوپلاسمای همراه با  گیاهان سنبل ختایی، برگ نو، لاله عباسی و کنف حشی بیشترین شباهت را به ترتیب با جدایه‌‌ هندی (mh393563.1; host; datura stramonium; identity: 98.94%)، جدایه‌‌ ترکیه‌‌ای (he649495.1; host; ligustrum sp.; identity: 99.24%)، جدایه‌‌ اوگاندایی (he649495.1; host; hibicus rosae;. identity: 99.14%) و جدایه‌‌ ایرانی (kx685880.1; host; eucalyptus sp. identity: 98.64%) داشتند. در ادامه درخت تبارزایی برای مقایسه‌‌ جدایه‌‌های ایرانی با سایر جدایه‌‌های مشابه گزارش شده جهان با نرم‌‌افزار mega 8.0  ترسیم گردید.

the first report on the detection and identification of phytoplasma pathogens associated with some ornamental plants of yazd city

in spring and summer 2023, a survey of plant samples from green spaces and ornamental greenhouses, along with adjacent weeds in yazd city, showed symptoms likely linked to phytoplasma disease. notable symptoms included stem flattening, phyllody, and yellowing observed in angelica archangelica, ligustrum sp., mirabilis jalapa, and hibiscus cannabinus. five samples from each plant were sent to the plant virology research center at shiraz university for dna extraction via the ctab method. polymerase chain reaction (pcr) was conducted using general primers (p1/p7) and nested primers (r16mf2/r16mr2) specific for phytoplasma. as expected, fragments of 1800 bp and 1250 bp were amplified with the general and nested primers, respectively. these fragments were excised from the gel, purified, and sent to sinohe company for sequencing. comparison of the sequences with those in the ncbi database using blast showed that the phytoplasmas from angelica archangelica, ligustrum sp., mirabilis jalapa, and hibiscus cannabinus were closely related to indian (mh393563.1; host: datura stramonium; identity: 98.94%), turkish (he649495.1; host: ligustrum sp.; identity: 99.24%), ugandan (he649495.1; host: hibiscus rosae; identity: 99.14%), and iranian (kx685880.1; host: eucalyptus sp.; identity: 98.64%) isolates. a phylogenetic tree was created to compare iranian isolates with similar global isolates using mega 8.0 software.