|
|
|
|
molecular interactions of danofloxacin with bovine serum albumin: an experimental and theoretical investigation
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
shaghaghi masoomeh ,rashtbari samaneh ,solouki laleh ,soltani somaieh ,dehghan gholamreza
|
|
منبع
|
iranian journal of analytical chemistry - 2022 - دوره : 9 - شماره : 2 - صفحه:1 -9
|
|
چکیده
|
Danofloxacin (dnf), a synthetic fluoroquinolone, is widely used as an antibacterial agent against a broad spectrum of pathogens. in the present study, the effects of dnf on the structure of bovine serum albumin (bsa) were investigated using uv-vis absorption and fluorescence spectroscopy, and molecular docking methods at different temperatures. the obtained results of uv-vis absorption studies showed that the microenvironment of the fluorophore residues does not significantly change upon interaction with dnf. also, fluorometric studies revealed bsa-dnf complex formation and fluorescence quenching of bsa in the presence of dnf. the number of binding sites and binding constants were calculated to be ~1 and in the order of 103, respectively. according to thermodynamic parameters, van der waals forces and hydrogen bonding play the main role in the bsa-dnf complex formation, which is a spontaneous process. the binding distance between dnf and bsa was calculated by the förster resonance energy transfer (fret) method. molecular docking results were in agreement with thermodynamic and spectroscopic data and confirmed the binding mechanism of dnf to bsa.
|
|
کلیدواژه
|
danofloxacin ,bovine serum albumin ,fluorescence quenching ,molecular docking
|
|
آدرس
|
payame noor university, department of chemistry, iran, university of tabriz, faculty of natural sciences, department of biology, iran, payame noor university, department of chemistry, iran, tabriz university of medical sciences, pharmaceutical analysis research center, pharmacy faculty, iran, university of tabriz, faculty of natural sciences, department of biology, iran
|
|
پست الکترونیکی
|
dehghan2001d@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
برهمکنش های مولکولی دانوفلوکساسین با آلبومین سرم گاوی: یک بررسی تجربی و تئوری
|
|
|
|
|
Authors
|
شقاقی معصومه ,رشت بری سمانه ,سلوکی لاله ,سلطانی سمیه ,دهقان غلامرضا
|
|
Abstract
|
چکیدهدانوفلوکساسین (dnf)، یک فلوروکینولون مصنوعی، به طور گسترده‌ای به عنوان یک عامل ضد باکتری در برابر طیف گسترده‌ای از عوامل بیماری زا استفاده می‌شود. در مطالعه حاضر، اثرات دانوفلوکساسین بر ساختار آلبومین سرم گاوی (bsa) با استفاده از تکنیک‌های طیف‌سنجی جذبی uv-vis و فلوئورسانس و روش‌های داکینگ مولکولی در دماهای مختلف مورد بررسی قرار گرفت. نتایج به‌دست‌آمده از مطالعات جذب uv-vis نشان داد که ریزمحیط باقی‌مانده‌های فلوروفور پس از برهمکنش با دانوفلوکساسین تغییر قابل‌توجهی نمی‌کند. همچنین، مطالعات فلورومتری تشکیل کمپلکس bsa-dnf و خاموش‌شدن فلوئورسانس آلبومین سرم گاوی را در حضور دانوفلوکساسین نشان داد. تعداد محل‌های اتصال و ثابت‌های اتصال به ترتیب 1~ و در مرتبه 103 محاسبه شد. با توجه به پارامترهای ترمودینامیکی، نیروهای واندروالسی و پیوند هیدروژنی نقش اصلی را در تشکیل کمپلکس bsa-dnf ایفا می‌کنند که یک فرآیند خود به خودی می‌باشد.. فاصله اتصال بین دانوفلوکساسین و آلبومین سرم گاوی با روش انتقال انرژی تشدید فورستر محاسبه شد. نتایج داکینگ مولکولی با داده‌های ترمودینامیکی و طیف‌سنجی مطابقت داشت و مکانیسم اتصال دانوفلوکساسین به آلبومین سرم گاوی را تایید کرد.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|