molecular design of nsalicyloyl tryptamine derivatives via quantitative structureproperty relationship )qspr( and molecular dynamic simulation methods

Nsalicyloyl tryptamine derivatives as antineuroinflammatory agents have a potent strategy to cure neuroinflammatory diseases including alzheimer and parkinson. computational methods of quantitative structure properties relationships (qspr) and molecular dynamics were successfully used to design of four novel nsalicyloyl tryptamine with improved properties. the qspr model of five variables was presented to predict anti neuroinflammatory activity of nsalicyloyl tryptamine derivatives. the quantum descriptors as hartree fock energy, ionization energy, softness, dipole moment and the thermal energy, were calculated with density functional theory at the b3lyp/6311g level. cross validation of multivariate linear regression (mlr) was used to build and evaluate the model qspr. the model possesses coefficients of the highest squared correlation coefficient (r2) of 0.900 for the training set and 0.817 for the test set. the statistical results exhibited high internal and external consistency as demonstrated by the validation methods. three of designed compounds showed good pharmacokinetic properties by qspr predictions. these results provided strong guidance for the discovery and design of novel potential anti neuroinflammatory compounds. also, the adsorption of the designed compounds on functionalized carbon nanotube (8, 0) was investigated using molecular dynamics simulation with compass force field. results indicated that the adsorption of designed nsalicyloyl tryptamine derivatives on fcnt involves a partial π–π interaction and hydrogen bonding. the study of investigation the interactions of nsalicyloyl tryptamine with fcnt (8, 0) can be useful for finding the main cntbased carriers for these derrivatives.

طراحی مولکولی مشتقات N سالیسیلول تریپتامین با استفاده از روش‌های رابطه کمی خواص ساختار و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

مشتقات N سالیسیلول تریپتامین به­عنوان عامل های ضد­حساسیت عصبی دارای پتانسیل درمانی بیماری های الزایمر و پارکینسون می­باشند. روش‌های محاسباتی روابط کمی خواص ساختار(QSPR) و شبیه­سازی دینامیک مولکولی برای طراحی چهار ترکیب جدید مشتقات N سالیسیلول تریپتامین بصورت موفقیت­آمیز استفاده گردید. مدل QSPR پنج متغیره برای پیش­بینی خواص و فعالیت ضد التهاب عصب مشتقات N سالیسیلول تریپتامین ارائه گردید. توصیف­گرهای کوانتومی مانند، انرژی هارتری فاک، انرژی یونش، ممان دوقطبی و انرژی گرمایی با استفاده از روش نظریه تابعیت چگالی در سطح B3LYP/6311G محاسبه گردید. اعتبارسنجی متقابل رگرسیون خطی چند متغیره MLR برای طراحی مدل QSPR استفاده گردید. مدل دارای بالاترین ضریب همبستگی R2 برابر 900/0برای سری آموزش و 817/0 برای سری تست می­باشد. نتایج آماری سازگاری داخلی و خارجی بالایی را بوسیله روش­های اعتبار سنجی نشان می­دهد. سه مورد از ترکیبات طراحی شده، خواص دارویی خوبی را با مدل QSPR ارائه می­دهند و می­تواند راهنمای مناسبی برای کشف و طراحی ترکیبات جدید با خاصیت ضد التهابی عصبی را فراهم می­نماید. همچنین جذب ترکیبات طراحی شده بر روی نانولوله کربنی (0و8) عامل­دار با استفاده از شبیه­سازی دینامیک مولکولی ومیدان نیرو COMPASS انجام گردید. نتایج جذب مشتقات طراحی شده بر نانولوله کربنی (0و8) عامل­دار نشان داد که برهمکنش­ها می­توانند شامل برهمکنش­های جزئی π–π و پیوندهای هیدروژنی باشند. مطالعه برهمکنش این ترکیبات با نانولوله کربنی (0و8) عامل­دار جهت یافتن حامل­های دارویی پایه نانولوله کربنی برای این مشتقات، می­تواند مناسب باشد.