بررسی متیلاسیون جزایر cpg ناحیه پروموتر ژن foxp3 در نمونه بیوپسی بیماران مبتلا به بیماری التهابی روده (ibd)

مقدمه: اخیرا نقش تغییرات اپی‌ژنتیکی foxp3 به‌عنوان یک فاکتور رونویسی تنظیمی مهم در عملکرد سلول‌های t تنظیمی (treg) ازجمله حفظ تحمل و تنظیم پاسخ‌های ایمنی در بیماری التهابی روده (ibd) پررنگ شده است. این مطالعه به منظور بررسی وضعیت متیلاسیون جزایر cpg در ناحیه پروموتر ژن foxp3 در پاتوژنز و پیش‌آگهی در بیماران مبتلا به ibd انجام‌شد.روش: نمونه بیوپسی بافت کولورکتال از 42 بیمار مبتلا به ibd فعال (22 بیمار مبتلا به کولیت اولسراتیو و 20 بیمار مبتلا به کرون) و 20 فرد سالم (گروه کنترل) گرفته‌شد. dna ژنومیک با کیت تبدیل بی‌سولفیتmethyl edge tm   مطابق پروتکل سازنده انجام‌شد. متیلاسیون ژن foxp3 با استفاده از pcr اختصاصی متیلاسیون مالتی پلکس کمی در زمان واقعی (qm-msp) بررسی‌شد. یافته‎ها: داده‌های سنجش متیلاسیون کمی نشان‌داد که متیلاسیون پروموتر ژن foxp3 در گروه بیماران ibd شامل بیماران مبتلا به cd (میانگین dna غیر متیله 0.218 ± 0.476) و بیماران مبتلا به uc (میانگین dna غیر متیله 0.487 ± 0.715) نسبت به گروه کنترل (1.152 ± 1.304) به‌طور قابل‌توجهی بالاتر بود (0.0001 ˂ p). همچنین هیچ تغییر معنی‌داری از نظر وضعیت متیلاسیون جایگاه‌های cpg در پروموتر ژن foxp3 بین دو گروه بیماران مبتلا به cd و بیماران مبتلا به uc مشاهده‌نشد (0.05 ˃ p).نتیجه‎گیری: متیلاسیون غیرطبیعی در ژن foxp3 به‌عنوان یک عامل تنظیم‌کننده مهم در ایمنی، می‌تواند منجربه کاهش عملکرد سلول‌های tregs و در نتیجه افزایش خطر ابتلا به بیماری‌های التهابی روده شود.

investigation of cpg island methylation in the promoter region of the foxp3 gene in biopsy samples from patients with inflammatory bowel disease (ibd)

introduction: recently, the role of epigenetic alterations in the foxp3 gene as an essential regulatory transcription factor in the function of regulatory t cells (tregs), including immune tolerance maintenance and response regulation in inflammatory bowel disease (ibd), has gained significant attention. this study aimed to investigate the cpg island methylation status in the promoter region of the foxp3 gene in the pathogenesis and prognosis of patients with ibd.methods: colorectal biopsy samples were obtained from 42 patients with active ibd (22 with ulcerative colitis (uc) and 20 with crohn’s disease (cd)) and 20 healthy controls. genomic dna was bisulfite-treated using the methyledge™ methylation kit according to the manufacturer’s protocol. foxp3 gene methylation status was assessed using quantitative real-time methylation-specific pcr (qm-msp).  results: quantitative methylation assessment data revealed that the foxp3 promoter methylation in the ibd patient groups, including cd patients (mean unmethylated dna 0.476±0.218) and uc patients (mean unmethylated dna 0.715±0.487), was significantly higher compared to the control group (mean 1.304±1.152) (p < 0.0001). no significant difference was found in the methylation status of cpg sites in the foxp3 promoter between cd and uc patients (p > 0.05).conclusion: abnormal methylation in the foxp3 gene, a critical immune regulator, can lead to impaired treg function and consequently increase the risk of inflammatory bowel diseases.