|
|
|
|
مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده mir-200 و ژن‌های هدف آن در سرطان پروستات
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
خراسانی مریم ,شهبازی شیرین ,مهدیان رضا
|
|
منبع
|
انفورماتيك سلامت و زيست پزشكي - 1397 - دوره : 5 - شماره : 4 - صفحه:495 -506
|
|
چکیده
|
مقدمه: با توجه به محدودیت‌های تست تشخیصی رایج سرطان پروستات، معرفی بیومارکرهای با ویژگی بالاتر جهت تشخیص دقیق‌تر و به‌هنگام سرطان پروستات مورد توجه می‌باشد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی خانواده mir200 (mir200a, mir200b, mir200c, mir141, mir429) و پیشبینی هدف‌های ژنی این خانواده، جهت بررسی بیشتر تحت عنوان بیوماکر تشخیصی بود.روش: این تحقیق از نوع تئوری و بر پایه بررسی بیوانفورماتیکی میکرو rna بود که به منظور جستجوی ژن‌های هدف خانواده mir200 در مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در پاتوژنز سرطان پروستات از پایگاه diana tollsmirpath v.3 استفاده شد. سپس به تایید ژن‌های معرفی شده توسط ابزارهای پیشگویی کننده آنلاین مانند mirwalk, targetscan, rnahybrid, پرداخته شد. در انتها نقش عملکردی ژن‌های هدف معرفی شده توسط پایگاه بیوانفورماتیک daivid بررسی شد.نتایج: با توجه به نتایج حاصل از این بررسی ژن e2f3 هدف مشترک تمام اعضای خانواده mir200 است، bcl2 به عنوان هدف مشترک mir200b/c/429 و ccne2 به عنوان هدف مشترک mir200a/141 بودند. همچنین mir200c با هدف قرار دادن cdkn1b و mir429 با هدف قرار دادن kras می‌تواننند در ایجاد سرطان پروستات مداخله کنند. نتیجه‌گیری: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که اعضای خانواده mir200 با هدف قرار دادن ژن‌های دخیل در پروسه‌های بیولوژیکی مهم و مسیرهای مولکولی دخیل در پاتوژنز سرطان پروستات احتمالاً می‌توانند تحت عنوان بیومارکر تشخیصی در مطالعات آتی مورد بررسی بیشتر قرار بگیرند.
|
|
کلیدواژه
|
سرطان پروستات، خانواده mir-200، پیشبینی بیوانفورماتیک
|
|
آدرس
|
انیستیتو پاستور ایران, بخش پزشکی مولکولی, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, گروه ژنتیک پزشکی, ایران, انستیتو پاستور ایران, گروه پزشکی مولکولی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
dr.reza.mahdian@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Bioinformatics Study of the miR-200 Family and the Target Genes in Prostate Cancer
|
|
|
|
|
Authors
|
Khorasani Maryam ,Shahbazi Shirin ,Mahdian Reza
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|