|
|
ارزیابی قرابتهای ژنتیکی پایههای منتخب ون برای تشکیل باغ بذر در ایستگاه تحقیقات چمستان
|
|
|
|
|
نویسنده
|
محمدی یوسف ,بنائی اصل فرزاد ,اسپهبدی کامبیز
|
منبع
|
پژوهش و توسعه جنگل - 1402 - دوره : 9 - شماره : 1 - صفحه:17 -27
|
چکیده
|
در امر بازسازی و گسترش جنگلها، نبود یا کمبود بذر اصلاحشده با تنوع ژنتیکی بالا، یکی از مهم ترین عوامل بازدارنده است. تشکیل باغ بذر علاوه بر تامین بذور تکرارپذیر و نهالهای با کیفیت، در تامین تنوع ژنتیکی کافی برای پژوهش های آینده نیز نقش مهمی ایفا میکند. 18 پایه مادری که از فنوتیپ مناسب (ظاهر سالم و بدون آفت و بیماری) برخوردار بودند، در جنگلی به مساحت تقریبی 100 هزار هکتار شناسایی و پس از جمعآوری نمونههای برگی، استخراج dna با روش ctab تغییر یافته انجام شد و همچنین واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از نشانگرهای ssr انجام شد. مشخصات آللی نشانگرهای تکثیر شده و همچنین شاخصهای ژنتیکی با نرم افزار genalex محاسبه و ماتریس ضرایب تشابه جاکارد و خوشه بندی 18 پایه منتخب با روشupgma با نرم افزارntsys انجام شد. بر اساس نتایج به دست آمده از الکتروفورز عمودی محصولات pcr، از 15 جفت نشانگر ssr، در 10 نشانگر ssr تکثیر قطعه انجام شد. در مجموع برای 10 نشانگر ssr، 57 آلل چند شکل در 18 پایه منتخب ون شناسایی شد، بهطوری که نشانگر fe3 با 10 آلل چند شکل، بیشترین و نشانگر fe5 با دو آلل، کمترین تعداد آلل چند شکل را به خود اختصاص دادند. خوشهبندی 18 پایه مختلف بر اساس روش upgma، نشان داد که پایههای منتخب با درنظر گرفتن ضریب تشابه 0.80، در 3 گروه اصلی قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده و برای تشکیل باغ بذر میتوان از پایههای p1، p2، p3، p4، p8، p9، p10، p15، p17 و نهایتاً p18 استفاده کرد.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، خوشهبندی، نشانگرهای ریزماهواره، ون
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان مازندران, بخش تحقیقات منابع طبیعی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
espahbodi.k@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
evaluation of genetic relationships of selected ash trees for seed orchard formation at chamestan research station
|
|
|
Authors
|
mohammadi y. ,banaei-asl f. ,espahbodi k.
|
Abstract
|
the absence or lack of improved seeds with high genetic variety has long been one of the most major obstacles to forest regeneration and growth. in addition to supplying replicable seeds and excellent seedlings, seed orchard creation is critical in providing enough genetic variety for future research. in a forest covering around 100,000 hectares, 18 maternal trees were discovered in three groups. the dna was extracted using a modified ctab technique, and the polymerase chain reaction was carried out with ssr markers. the allelic features of amplified markers, as well as genetic indices, were determined using genalex software, and the similarity matrix of jaccard coefficients, as well as the clustering of 18 chosen trees, were performed using the upgma technique and ntsys software. fragment amplification was done in 10 ssr markers based on the findings of vertical electrophoresis of pcr products from 15 pairs of ssr markers. in all, 57 polymorphism alleles were discovered in 18 chosen ash for 10 ssr markers, with the fe3 marker having the most (ten polymorphic alleles) and the fe5 marker having the fewest (two polymorphic alleles). each ssr marker had an average of 5.7 polymorphic alleles. the clustering of 18 distinct trees using the upgma algorithm revealed that the chosen trees were divided into three major clades. the p1, p2, p3, p4, p8, p9, p10, p15, p17, and ultimately p18 plants can be utilized to build a seed orchard based on the results.
|
Keywords
|
ash ,clustering ,genetic diversity ,ssr markers
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|