تنوع ژنتیکی قارچ‌های اندوفیت درختچه شیرخشت (‏cotoneaster integerrimus medik.‎‏) ارسباران‏

قارچ های اندوفیت گیاهی نقش مهمی در فعل و انفعالات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گیاهان در پاسخ به شرایط محیطی ایفا می کنند. در همین راستا، شناسایی قارچ های اندوفیت گونه شیرخشت در ارسباران هدف گذاری شد. نمونه های برگ و ساقه از گیاه مذکور جداسازی و پس از ضدعفونی سطحی، در محیط کشت pda حاوی استرپتومایسین کشت شدند. پس از رشد هیف های قارچی و واکشت کردن آن ها، از محیط کشت pdb برای ادامه کار استفاده شد. برای شناسایی ایزوله های قارچی رشد کرده، استخراج dna و واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای نواحی فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (internal transcribed spacer) انجام شد. نتایج حاصل از pcr، نشان داد که از 15 ایزوله جداسازی- شده، در 9 ایزوله قطعه its تکثیر شد. به طوری که 3 ایزوله در گونه penicillium sizovae، 3 ایزوله در گونه alternaria alternate، 2 ایزوله در جنس penicillium و ایزوله آخر به دلیل شباهت کم توالی its آن با داده پایگاه، نامگذاری نشد و احتمالا گونه جدیدی باشد و نیاز به پژوهش های تکمیلی دارد. تجزیه وتحلیل فیلوژنتیک، 4 گونه مورد نظر را در 2 کلاد کاملا متمایز قرار داد، به طوری که کمترین فاصله ژنتیکی بین 2 گونه penicillium و بیشترین فاصله نیز بین 2 ایزوله penicillium sp و fungal sp وجود دارد. این بررسی اولین گزارش در ارتباط با قارچ های اندوفیت شیرخشت بوده و نشان می دهد که این گونه گیاهی میزبان تعداد و طیف کمی از قارچ های اندوفیت است.

genetic diversity of endophytic fungi of arasbaran cotoneaster integerrimus

plant endophytic fungi play an important role in the physiological and biochemical interactions of plants in response to environmental conditions and by producing specific secondary metabolites. in addition to preserving the host plant, they also gain economic importance. in this regard, the identification of endophytic fungi of arasbaran cotoneaster integerrimus shrub was targeted. leaf and stem samples were isolated from the plant and, after surface disinfection, were cultured in a pda medium containing streptomycin. after growing fungal hyphae and culturing them, the pdb medium was used to continue the work. to identify the grown fungal, dna extraction was performed and polymerase chain reaction was performed using internal transcribed spacer (its) primers. pcr results showed that out of 15 isolated isolates, the its fragment was amplified in 9 isolates. as 3 isolates in penicillium sizovae, three isolates in alternaria alternate, two isolates in penicillium and the last isolate were not named due to the low similarity of its its sequence with the database data and it is probably a new species and needs further studies. phylogenetic analysis identified the four species in two completely distinct clades, so that the lowest genetic distance observed between the two penicillium species and the maximum distance observed between the penicillium sp and fungal sp. the present study is the first report on cotoneaster integerrimus endophytic fungi and shows that this plant hosts a small number and range of endophytic fungi.