|
|
بررسی تنوع ژنتیکی نوش (thuja orientalis) با استفاده از نشانگر پراکسیداز در ذخیرهگاه جنگلی سورکش
|
|
|
|
|
نویسنده
|
خزائی پول معصومه ,آزادفر داوود ,سعیدی زهره
|
منبع
|
پژوهش و توسعه جنگل - 1400 - دوره : 7 - شماره : 3 - صفحه:387 -401
|
چکیده
|
هدف این پژوهش تعیین و مقایسه تنوع ژنتیکی جمعیتهای نوش در ذخیرهگاه جنگلی سورکش بهکمک چندشکلی نشانگر بیوشیمیایی پراکسیداز در دو اندام شاخه و فلس بوده است. نمونهبرداری بهطور همزمان از فلس و شاخه دوساله 30 پایه نوش از سه جمعیت انجام شد. نمونهها از ارتفاع میانه تاج و از جهت ثابت جنوبی تاج شده شدند. تجزیه و تحلیل دادهها بهکمک نرمافزار genalex در خصوص ویژگیهای آللی نشانگرهای مورد پژوهش و مقایسه توانایی دو اندام و گروهبندی پایهها برای بررسی تنوع درون و بین جمعیتی توسط تحلیل خوشهای دادههای الکتروفورتیکی (ژلهای تهیه شده) توسط نرمافزار ntsys 2.02 انجام شد. بررسی کیفی با الکتروفورز عمودی بهروش page (پلی آکریل آمید ژل الکتروفورز) انجام شد و دادههای الکتروفورتیکی پایههای هر منطقه بهکمک تحلیل خوشهای گروهبندی شدند. با توجه بهنتایج، جمعیت دو با میانگین تعداد آلل مشاهده شده در هر جایگاه ژنی (2)، میانگین تعداد آلل موثر (1.77)، هتروزیگوتی قابل انتظار (0.42) و درصد پلیمورفیسم (100) دارای بیشترین شاخصهای تفکیک آللی نسبت به دو جمعیت دیگر است. همچنین تنوع درون جمعیتی (حدودا 60) بیشتر از تنوع بین جمعیتی (حدودا 40) بهدست آمد که باید در مدیریت این ذخیرهگاه برای افزایش تنوع مدنظر قرار گیرد. همچنین اندام فلس در نوش با میانگین تعداد آلل مشاهده شده در هر جایگاه ژنی (1.48)، میانگین تعداد آلل موثر (1.49)، هتروزیگوتی قابل انتظار (0.27)، میانگین شاخص اطلاعات شانون (0.39)، تعداد باند (9) و درصد چندشکلی (66.67) نسبت به ویژگیهای آللی اندام شاخه دارای مقادیر بیشتری در پژوهش های تنوع ژنتیکی است.
|
کلیدواژه
|
الکتروفورز، تنوع درون جمعیتی، سورکش، نشانگر بیوشیمیایی
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده منابع طبیعی, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده منابع طبیعی, گروه جنگلشناسی و اکولوژی جنگل, ایران, اداره کل منابع طبیعی و آبخیزداری استان گلستان, ایران
|
پست الکترونیکی
|
saeedizohre@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Study of genetic diversity Thuja orientalis by Peroxidase marker in reserved forest of Sorkesh
|
|
|
Authors
|
Khazaei poul Masoumeh ,Azadfar Davoud ,Saeedi Zohreh
|
Abstract
|
The aim of this study was to determine and compare the genetic diversity of wild populations of Thuja orientalis by biochemical markers polymorphism of leaves and twoyearold branches Peroxidase. The sampling was done in 30 individuals of Thuja orientalis in three populations. Samples were taken from medium crown height in the south direction. Data analysis was performed by GenAlEx software on the allele characteristics of the studied markers and comparing the ability of these two organs and grouping of the trees to examine the intra and interpopulation variation by cluster analysis of electrophoretic data (prepared gels) by NTSYS 2.02 software. Qualitative measures was studied by vertical electrophoresis and PAGE (polyacrylamide gel electrophoresis) method and the electrophoretic data were classified using cluster analysis. According to the results, the second population with the average number of alleles observed per gene locus (2), the average effective number of alleles (1.77), the expected heterozygosity (0.42), and the percentage of polymorphism (100) have the most allelic separation indices in comparison to the other two populations. Also, the higher genetic diversity in intra population (nearly 60) than interpopulations (nearly 40) should be considered in the management of this reserved forest to increase diversity. Also, the scale in Thuja sp. with the average number of alleles observed per gene locus (1/48), the average effective number of alleles (1.49), the expected heterozygosity (0.27), mean Shannon’s information index (0.39), number of bands (9) and percentage of polymorphism (66/67) has better allelic characteristics than the branch in genetic diversity studies.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|