|
|
|
|
بررسی ساختار تنوع ژنتیکی جمعیت‌های گندم نیای وحشی aegilops cylindrica با استفاده از لوکوس‌های بین ریزماهواره ژنومی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
محمدی سمیرا ,اشرف مهرابی علی ,آرمینیان علی ,فاضلی آرش
|
|
منبع
|
پژوهش هاي ژنتيك گياهي - 1393 - دوره : 1 - شماره : 1 - صفحه:13 -26
|
|
چکیده
|
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 35 جمعیت aegilops cylindrica با استفاده از 17 آغازگر issr، در مجموع 190 آلل تکثیر شدند که از این تعداد، 188 آلل (95/98 درصد)، به عنوان آلل چندشکل تشخیص داده شدند. تعداد آلل های تکثیر شده از 6 تا 20 با میانگین 18/11 آلل متغیر بود. محتوای اطلاعات چندشکلی از 10/0 در آغازگر ubc841 تا 35/0 برای آغازگر ubc836 متفاوت بود. همچنین شاخص نشانگر از 6/0 برای آغازگر ubc841 تا 6 برای آغازگر 15 متفاوت بود. روش های گروه بندی خوشه ای و تجزیه به مختصات اصلی نتوانست جمعیت ها را به طور کامل از هم تفکیک کند و عدم ارتباط بین تنوع مولکولی و تنوع جغرافیایی را نشان داد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالای این جمعیت ها می باشد. در مجموع جمعیت های غرب و جنوب غرب کشور، تنوع بیشتری نسبت به جمعیت های شمال و شمال غرب کشور نشان دادند، بنابراین مرکز تنوع و پیدایش گونه ae. cylindrica احتمالاً غرب و جنوب غرب کشور بوده و از این مناطق به سمت شمال کشور انتقال یافته اند. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای issr ابزار مفیدی برای مدیریت منابع ژنتیکی خویشاوندان وحشی گندم می باشد.
|
|
کلیدواژه
|
aegilops cylindrica، تجزیه به مختصات اصلی، تجزیه خوشه‌ای، تنوع ژنتیکی، نشانگر issr
|
|
آدرس
|
دانشگاه ایلام, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه ایلام, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه ایلام, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه ایلام, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetic Diversity Structure of Aegilops cylindrica Accessions Revealed by Genomic ISSR Markers
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
Abstract
|
Genetic diversity among 35 accessions of Ae. cylindrica using 17 ISSR primers were investigated. Totally, 190 alleles were amplified and 188 alleles (98.95%) o were polymorphic. Number of Amplified alleles ranged from 6 to 20 with average 11.18 alleles for each primer. Polymorphic information content (PIC) varied from 0.10 (primer UBC841) to 0.35 (primer UBC836). Marker index criterion ranged from 0.6 (primer UBC841) to 6 (primer 15). Cluster and Principal Coordinate Analysis could not completely separate accessions and showed no association between molecular diversity and geographic diversity of genotypes, indicating that there is high genetic diversity among accessions. West and southwest genotypes showed more diversity than genotypes from north and northwest of the country. Therefore, the center of diversity and origin of Aegilops cylindrica might be the western and southwestern regions of country and this species might transferred from these regions to the northern parts of the country. Results of this study showed that ISSR markers are useful tools for management of genetic resources of wheat and their wild relative species.
|
|
Keywords
|
Aegilops cylindrica ,Cluster analysis ,Genetic diversity ,ISSR marker ,Principal coordinate analysis ,Aegilops cylindrica
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|