شناسایی qtl‌های پیوسته به برخی صفات دانه در گندم نان با استفاده از نقشه‌یابی ارتباطی

این مطالعه به منظور شناسایی نشانگر های پیوسته به برخی صفات دانه گندم انجام شد. یک صد ژنوتیپ گندم، در قالب طرح آلفا لاتیس با دو تکرار کشت شدند و پس از برداشت دانه ی ژنوتیپ های مورد آزمایش، صفاتی چون سختی دانه، طول، عرض و وزن هزار دانه ی آن ها اندازه گیری شد. نقشه یابی ارتباطی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره، در کل ژنوم و همچنین برخی نشانگرهای ریزماهواره پیوسته به کیو.تی.ال ها (qtls)، انجام گرفت. از تعداد 96 نشانگر به منظور بررسی ساختار جمعیت و 22 نشانگر پیوسته به صفات استفاده شد. ساختار جمعیت، با استفاده از نرم افزار structure تعیین شد و ژنوتیپ ها به شش زیر جمعیت تقسیم شدند. در مجموع تعداد 35 نشانگر پیوسته به صفات با استفاده از نرم افزار tassel شناسایی شدند که از این تعداد هشت نشانگر ssr پیوسته به کیو.تی.ال بودند. سایر نشانگرها که با صفات پیوستگی نشان دادند برای بررسی ساختار جامعه مورد استفاده قرار گرفته بودند. نشانگرهای پیوسته به کیو.تی.ال برای صفات، سختی دانه در کروموزوم 5b، 5d و 6d، طول، عرض و وزن هزاردانه در کروموزوم های 1b، 2b، 2d، 5b، 5d، 6d، 7b و 1a شناسایی شدند. نتایج این مطالعه نشان داد که نقشه یابی ارتباطی می تواند به عنوان یک روش مکمل برای مکان یابی کیو.تی.ال به منظور انتخاب به کمک نشانگر در گندم نان مورد استفاده قرار گیرد.

Detection of QTLs Associated to Some Grain Traits in Bread Wheat (Triticum aestivum L.), Using Association Mapping

This study was conducted to identify markers associated with some kernel traits in bread wheat in two separate experiments under field and laboratory. One hundred wheat genotypes were evaluated in an alpha lattice experimental design with two replications. Grain hardness, seed length, seed width and thousand kernel weights were measured. Association mapping was performed based on 96 unlinked and 22 SSR QTL linked markers, using structure and Tassel software. Correction for population structure was performed using genome wide SSR markers so that genotypes were divided into six subpopulations. Totally, 35 SSR markers linked to traits were detected eight of them being QTL linked markers and other markers that were linked to traits, were used to investigate population structure. The QTLs linked markers were as follows: Chromosomes 5B, 5D and 6D had three QTL for grain hardness. Nine QTLs were detected on chromosomes 1A, 1B, 2A, 2B, 2D, 5B, 5D, 6D and 7B for kernel length, kernel width and thousand kernel weights. The results of this study demonstrate that association mapping is a useful approach to complement and enhance previous QTL information for markerassisted selection in wheat.