|
|
شناسایی و بررسی خانواده ژنی wrky در گیاه کاملینا (camelina sativa) و شناسایی مهمترین اعضای ژنی درگیر در تنش خشکی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
سیدحسنپور مریم ,نژاد صادقی لیلا ,شبر زهرا سادات ,کهریزی دانیال
|
منبع
|
پژوهش هاي ژنتيك گياهي - 1402 - دوره : 10 - شماره : 2 - صفحه:63 -78
|
چکیده
|
کاملینا با نام علمی camelina sativa گیاهی یکساله، خودگشن، آلوهگزاپلوئید با توارث دیپلوئیدی و متعلق به خانوادهی براسیکاسه میباشد که شباهت زیادی به گیاه مدل arabidopsis thaliana دارد. عوامل رونویسی wrky یکی از مهمترین خانوادههای ژنی در گیاهان هستند که نقش مهمی در تنظیم رشد و نمو و پاسخ به تنشهای مختلف ایفا میکنند. در این پژوهش با استفاده از ابزارها و پایگاههای داده، اعضای خانواده ژنی wrky در گیاه کاملینا شناسایی و ویژگیهای مختلف آنها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این بررسی تعداد 214 عضو از خانواده ژنی wrky را در ژنوم گیاه کاملینا مشخص کرد. تمامی ژنهای شناسایی شده دارای دمین عملکردی محافظت شده wrky و موتیفهای مختلفی در ساختار خود بودند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی اعضای شناسایی شده خانواده ژنی wrky گیاه کاملینا را به چهار گروه اصلی تقسیمبندی کرد. بررسی موقعیت کروموزومی نشان داد که 214 عضو خانواده ژنی wrky شناسایی شده بهطور نامساوی روی کروموزومهای این گیاه توزیع شدهاند. بهمنظور اعتبارسنجی پژوهش، بیان دو ژن csa11g065620 و csa07g035970 که ارتولوگهای دو ژن wrky8 و wrky57 درگیر در تنش خشکی بودند، در دو لاین دابلهاپلوئید متحمل (dh 91) و حساس (dh 101) به تنش خشکی در شرایط تنش خشکی بررسی شد. نتایج بررسی بیان ژنها نشان داد که دو ژن مذکور در شرایط تنش خشکی در لاین متحمل (dh 91) بیان بالایی نسبت به شرایط نرمال داشتند، ولی در لاین حساس (dh 101) تفاوت بیان معنیداری بین ژنها مشاهده نشد. نتایج این پژوهش اطلاعات مناسبی را برای مطالعه تکاملی و عملکرد خانواده ژنی wrky در کاملینا فراهم آورده است و میتواند گامی مفید در پیشبرد مطالعات بیشتر در مورد نقش خانواده ژنی wrky در گیاه کاملینا باشد.
|
کلیدواژه
|
تنشهای محیطی، خانواده ژنی، دمین حفاظتشده، عوامل رونویسی wrky، فیلوژنتیکی
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه تولید و ژنتیک گیاهی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه تولید و ژنتیک گیاهی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران, گروه زیستشناسی سیستمها, ایران, دانشگاه رازی, دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی, گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
dkahrizi@razi.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
identification and investigation of wrky gene family in camelina plant (camelina sativa) and identification of the most important gene members involved in drought stress
|
|
|
Authors
|
seyed hassan pour seyede maryam seyed ,nejadsadeghi leila ,shobbar zahra sadat ,kahrizi danial
|
Abstract
|
camelina )camelina sativa (is an annual, self-pollinating, allohexaploid plant with diploid inheritance belonging to the brassicaceae family. camelina exhibits a remarkable degree of similarity to the model plant arabidopsis thaliana. wrky transcription factors are among important gene families in plants that play crucial roles in regulating growth and development and in response to diverse stresses. in this research, using bioinformatics analysis and databases, members of the wrky gene family were identified and their various characteristics were investigated. overall, the genome of the camelina plant was found to harbor 214 members of the wrky gene family. all 214 wrky genes were found to possess the conserved wrky functional domain, along with a variety of motifs within their structural composition. phylogenetic analysis divided the identified members of camelina wrky genes into four main groups. examination of the chromosomal positions revealed that the 214 identified wrky genes exhibited an uneven distribution across the chromosomes. in order to validate the identified genes, the expression of two genes (csa11g065620 and csa07g035970) orthologs of two genes involved in drought stress in arabidopsis (wrky8 and wrky57), were investigated in a drought tolerant (dh 91) and a drought sensitive (dh 101) lines. the results of the gene expression analysis showed that both genes had high expression in drought stress conditions in tolerant line in comparison to normal conditions, whereas no significant expression was found in drought sensitive line. the findings of the present study offer valuable insights for evolutionary investigations and enhance our understanding of the functional roles of the wrky gene family in camelina, thereby laying a foundation for future research endeavors in this field.
|
Keywords
|
environmental stresses ,gene family ,conserved domain ,wrky transcription factors ,phylogenetic
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|