استفاده از نشانگرهای ssr جهت تفکیک ژنتیکی برخی ارقام تجاری نخل خرما

در نخل خرما، تشخیص رقم در نهال‌های جوان حاصل از ریزازدیادی با استفاده از صفات مورفولوژیک دشوار و زمان‌بر بوده و بنابراین استفاده از نشانگرهای مولکولی جهت تسهیل و تسریع این موارد ضروری به نظر می‌رسد. هدف از این مطالعه بررسی قابلیت هشت جفت نشانگر ریزماهواره برای تفکیک و تشخیص رقم در برخی ارقام تجاری و متعاقباً استفاده از داده‌ها برای تشخیص رقم در گیاهچه‌های خرمای حاصل از ریزازدیادی بود. ارقام مورد مطالعه شامل پیارم، زاهدی، مجول، برحی، استعمران، دیری، غنامی سبز، غنامی قرمز و گنطار بودند. با توجه به دشواری کوبیدن برگ خرما با استفاده از هاون در حضور ازت مایع، روشی کارآمد برای کوبیدن برگ‌های خرما با استفاده از دستگاه tissue lyser ii بهینه‌سازی شد. برای انجام واکنش‌های زنجیره‌ای پلی‌مراز از هشت جفت آغازگر ریزماهواره استفاده شد. نتایج نشان داد که در صورت استفاده از این سیستم نشانگری و در دسترس بودن ارقام شاهد قابل‌اطمینان، می‌توان اصالت گیاهچه‌های حاصل از ریزازدیادی را ارزیابی کرد. گروه‌بندی ارقام نشان داد که تمامی ارقام مورد مطالعه با استفاده از پنج جفت آغازگر ریزماهواره شامل mpdcir025، mpdcir057، mpdcir070، pdag1003 و dp175قابل تفکیک بودند. نتایج حاصل از تهیه بارکد اختصاصی برای هر رقم نشان داد که آلل‌ شماره c1 (با اندازه تقریبی 235 جفت‌باز) در رقم پیارم و آلل‌ d3 (با اندازه تقریبی 230 جفت‌باز) در رقم مجول اختصاصی بودند. در نهایت برای ایجاد قابلیت رجوع به نتایج، دیاگرام تفکیک ارقام ترسیم شد.

Application of SSR Markers for Genetic Segregation of Some Commercial Date Palm Cultivars

Cultivar identification in micropropagated date palm seedlings is laborious so that application of molecular markers to facilitate and acceleration of the procedure seems inevitable. Given the need for control the originality of micro propagated date palm seedlings, the aim of this study was evaluation of SSR markers usability to cultivar identification in micropropagated date palm seedlings. Original samples of Green Ghanami, Red Ghanami, Gantar, Deiry, Ostaemran, Barhi, Medjool, Zahedi and Piarum cultivars were used control. Taking into account the rigidity of leaves and subsequently high consumption of liquid nitrogen to powder leaves, an efficient method for powdering of leaves using Tissue Lyser II instrument was optimized. Eight SSR primer pairs were used for polymerase chain reaction. The Results showed that by using these molecular markers and reliable controls, determination of micro propagated date palm cultivars is feasible. Clustering of cultivars showed that all of them were differentiated using five SSR primer pairs including mPdCIR025, mPdCIR057, mPdCIR070, PDAG1003 and DP175. Also, barcoding of scored band illustrated that c1 allele (230 to 240 bp) for Piarum cultivar and d3 allele (220 to 230 bp) for Medjool cultivar were exclusive. Totally to make the results referable, cultivar identification diagram was drawn up.