|
|
ارزیابی تنوع ژنوتیپهای جو (.hordeum vulgare l) بر اساس محتوای بتاگلوکان و نشانگرهای issr
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عزیزنیا راحله ,بدخشان هدیه ,جوادی تیمور ,زمانی سوما
|
منبع
|
پژوهش هاي ژنتيك گياهي - 1398 - دوره : 6 - شماره : 2 - صفحه:97 -110
|
چکیده
|
در این مطالعه، تنوع محتوای بتاگلوکان دانه، در 20 لاین و رقم جو بر اساس طرح بلوکهای کامل تصادفی در سه تکرار مورد بررسی قرار گرفت. هم چنین، تنوع ژنتیکی بین این ژنوتیپ ها، با استفاده از نشانگر issr ارزیابی شد. استخراج بتاگلوکان به روش آنزیمی انجام گرفت. از نظر محتوای بتاگلوکان دانه در بین ژنوتیپهای جو، اختلاف معنیدار در سطح احتمال یک درصد وجود داشت. محتوای بتاگلوکان دانه بین 7.21 تا 12.48 درصد متغیر بود و بیشترین مقدار محتوای بتاگلوکان، در ژنوتیپهای یوسف، e94b3 و e94b17 اندازهگیری شد. آغازگرهای issr با متوسط درصد چندشکلی 69.79 درصد، تنوع ژنتیکی 0.25 و شاخص شانون 0.37 در بررسی تنوع ژنتیکی بسیار کارآمد عمل کردند. لاینها و رقمهای جو، در دو گروه مجزا با مطابقت زیاد با شجره ژنتیکی، از هم متمایز شدند. تعداد نه آغازگر دارای اطلاعات برای محتوای بتاگلوکان دانه توسط روشهای ناپارامتری کروسکالوالیس، همبستگی اسپیرمن و تجزیه رگرسیون گام به گام شناسایی شدند. درصد تبیین تغییرات محتوای بتاگلوکان دانه توسط این آغازگرها، بین 24.3 تا 42.4 متغیر بود. آغازگرهای issr6(700)، ترکیب issr1+issr4(1400) و ترکیب is2+issr2(1400) دارای ارتباط قویتری با محتوای بتاگلوکان بودند. آغازگرهای دارای اطلاعات، امکان گزینش کارآمد ژنوتیپهای جو با محتوای بتاگلوکان بالاتر را فراهم میآورند.
|
کلیدواژه
|
بتاگلوکان، جو، رگرسیون گام به گام، کروسکال-والیس، نشانگرهای دارای اطلاعات
|
آدرس
|
دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاحنباتات, ایران, دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه باغبانی, ایران, دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Assessment of Diversity in Barley Genotypes (Hordeum vulgare L) Based on Beta-Glucan Content and ISSR Markers
|
|
|
Authors
|
Aziznia Raheleh ,Badakhshan Hedieh ,Javadi Taimoor ,Zamani Soma
|
Abstract
|
In this study, variation of betaglucan content was assessed in 20 barley line and cultivars based on complete block design with three replications. Genetic diversity of these genotypes was also evaluated using ISSR markers. Betaglucan extracted by an enzymatic method. Significant differences were found at the level of 1% among barley genotypes for betaglucan content. The beta glucan content was variable from 7.21 to 12.48 and, the Yosef, E94B3 and E94B17 genotypes hold the highest content of the betaglucan. ISSR primers with average polymorphism of 66.79%, genetic diversity of 0.25 and Shannon index of 0.37 were determined as efficient markers for studying genetic diversity. The barley lines and cultivars were assigned in two distinct groups according to their genetic pedigree. On the basis of nonparametric KruskalWallis, Spearman correlation, and stepwise regression analysis, nine informative primers were detected explaining highest seed rsquo;s betaglucan content variations ranging from 24.3 to 42.4 percent. The ISSR6 (700), the combination of ISSR1+ISSR4 (1400) and IS2+ ISSR2 (1400) primers were the most informative primers for the betaglucan content. The informative markers provide possible functional and efficient marker based selection method and, screening the barley germplasms for the highest betaglucan content.
|
Keywords
|
Barley ,Beta-glucan ,Informative markers ,Kruskal-Wallis ,Stepwise regression
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|