بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های بابونه آلمانی کشت شده در ایران با استفاده از نشانگر scot

بابونه آلمانی با نام علمی (chamomilla matricaria) گیاهی علفی، یکساله از تیره کاسنی است. بابونه از دیرباز عمدتا به منظور استفاده از اسانس و عصاره آن در صنایع دارویی ،آرایشی و بهداشتی، عطرسازی و چاشنی های غذایی به عنوان ستاره ای در میان گیاهان دارویی مطرح بوده است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی در نه جمعیت بابونه آلمانی با استفاده از نشانگر ملکولی scot انجام شد. ده آغازگر scot مورد استفاده قرار گرفت، آغازگرها نوارهای چندشکل با الگوی نواری واضح ایجاد کردند. در مجموع 141 نوار ایجاد شد که از این بین 140 نوار (96.5 درصد) چندشکلی نشان دادند. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از الگوریتم upgma و بر اساس ضریب تشابه جاکارد انجام شد، نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای و تجزیه به مولفه‌های اصلی توانست نمونه‌های جمعیتی بابونه را به چهار گروه تقسیم نماید. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (amova) نشان داد میزان تنوع بین گروهی بیشتر از تنوع درون گروهی است به طوری که 55 درصد تنوع مربوط به تنوع بین گروه‌ها بود. نتایج این پژوهش نشان داد نشانگرهای scot در تعیین میزان تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی نمونه‌های جمعیتی مورد مطالعه بابونه از کارایی بالایی برخوردار هستند.

Evaluation of genetic diversity among Iranian chamomilla Matricaria using Scot Markers

German chamomile (Matricaria chamomilla L.) is an s an annual plant of the composite family Asteraceae. This plant is native to the Mediterranean region, and some researchers have reported its origins in Asia. The aim of this study was to investigate the genetic diversity of nine chamomile populations using the SCoT marker. Ten SCoT primers were used. A total of 141 bands were produced, of which 140 bands (96.5%) showed polymorphism. Cluster analysis was performed using UPGMA algorithm based on Jaccard's coefficient of similarity. The results of cluster analysis and principal components analysis divided the chamomile population into four groups. The results of the analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the intergroup variation was greater than the intragroup variation, so that 55% of variation was related to the diversity among the groups. The results of this study showed that SCoT markers have high efficiency in determining the genetic diversity and relationships of the chamomile populations.