|
|
|
|
مقایسه تنوع dna کلروپلاستی برخی ژنوتیپ‌های سیب ایرانی، ارقام تجاری و برخی پایه‌های متداول
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
جهانگیرزاده خیاوی شاهین ,زمانی ذبیح اله ,فتاحی محمدرضا ,عاشورپور معصومه
|
|
منبع
|
پژوهش هاي ژنتيك گياهي - 1397 - دوره : 5 - شماره : 1 - صفحه:77 -86
|
|
چکیده
|
Dna کلروپلاستی 64 نمونه سیب (malus spp.) (54 ژنوتیپ بومی ایران، پنج رقم تجاری و پنج پایه) برای مشخص کردن هاپلوتایپ های آنها با کاربرد روش واکنش زنجیره ای پلی مرازتفاوت طول قطعات حاصل از هضم (pcrrflp) بررسی شد. تقریبا bp4320 از ژنوم کلروپلاست با کاربرد دو جفت آغازگر عمومی کلروپلاست و دو آنزیم برشی محدودگر (msei و ecori) بررسی گردید. تمام جهش های شناسایی شده، حذفاضافه در محدوده bp4010 بودند. ترکیب تمام جهش ها، شش هاپلوتایپ (h1, h2, h3, h4, h5, h6) را در نمونه های مورد بررسی معرفی نمود. مشخص شد که پایه سیب بومی رقم گمی آلماسی هاپلوتایپ اختصاصی خود را دارا بوده و از تمامی نمونه های مورد بررسی منطقه خود (آذربایجان) متفاوت است. اطلاعات تنوع dna کلروپلاستی می تواند برای مطالعات فیلوژنتیکی در این گیاه به کار رود و چند شکلی های مشخص شده در ژنوم سیتوپلاسمی با روش pcrrflp می تواند به درک وراثت مادری سیب کمک کند.
|
|
کلیدواژه
|
آغازگر عمومی کلروپلاست، آنزیم برشی محدودگر، سیب، هاپلوتایپ، pcr-rflp
|
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی لاهیجان, موسسه تحقیقات علوم باغبانی، پژوهشکده چای, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده کشاورزی, گروه علوم باغبانی, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده کشاورزی, گروه علوم باغبانی, ایران, سازمان جهاد کشاورزی گیلان, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Comparison of Chloroplast DNA Diversity in Some Iranian Apple Genotypes, Commercial Cultivars and Rootstocks
|
|
|
|
|
Authors
|
Jahangirzadeh Khiavi Shahin ,Zamani Zabihollah ,Fatahi Mohamadreza ,Ashourpour Masoumeh
|
|
Abstract
|
The chloroplastic DNA of 64 accessions of apple (Malus spp.) (54 Iranian genotypes, five commercial cultivars and five rootstocks) were analyzed to reveal their haplotypes by using Polymerase Chain ReactionRestriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP) method. Approximately 4320 bp of the chloroplast genome was analyzed, by using two chloroplast universal primer pairs and two restriction enzymes (EcoRI and MseI). All the mutations detected were insertiondeletions been in the range between 1040 bp. The combination of all the mutations resulted to six haplotypes (H1, H2, H3, H4, H5 and H6) in the studied apple accessions. It was defined that the Iranian apple rootstock 'GamiAlmasi' had a specific haplotype form all the other studied accessions. It was approved that cpDNA diversity data can be considered for phylogenetic studies in this plant and the polymorphism determined in cytoplasmic genome by PCRRFLP method can help to understand the maternal inheritance in apple.
|
|
Keywords
|
Chloroplast universal primer ,Restriction enzyme ,Malus Spp ,Haplotype ,PCR-RFLP ,PCR-RFLP
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|