شناسایی آلل‌های حاوی اطلاعات در کنترل صفات برنج تحت شرایط غرقاب و تنش خشکی‌‌

تعیین رابطه بین ژنوتیپ و فنوتیب یکی از اهداف اصلی پروژه های به نژادی است. امروزه نشانگرهای مولکولی ابزارهای قدرتمندی برای ارزیابی این ارتباط در اختیار به نژادگران قرار می دهند. در این بررسی تنوع ژنتیکی 112 لاین برنج با استفاده از 20 جفت نشانگر ریزماهواره پیوسته با آلل های تحمل به خشکی مورد بررسی قرار گرفت که درمجموع 77 آلل چند شکل با میانگین 3/85 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. کم ترین تعداد آلل مربوط به نشانگرهای rm28199 و rm212 با 2 آلل و بیشترین آن مربوط به نشانگر rm72 با 6 آلل بود. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرهای مورد بررسی بین 0/30 تا 0/72 با میانگین 0/58 بود که بیشترین مقدار مربوط به نشانگر rm85 و rm20a و کم ترین آن مربوط به نشانگر rm28099 بود. از نظر تنوع ژنی، نشانگرهای rm28099 و rm85 به ترتیب کم ترین (0/33) و بیشترین (0/76) تنوع را داشتند. نتایج تجزیه رگرسیون گام به گام داده های ریز ماهواره و صفات مورفولوژیک در شرایط غرقاب 62 آلل و در شرایط تنش خشکی 54 آلل آگاهی بخش را برای صفات ارزیابی شده، شناسایی نمود. تجزیه خوشه ای بر اساس داده های مولکولی ژنوتیپ ها را به 7 گروه تقسیم نمود. با توجه به توزیع مناسب dna تکثیرشده توسط نشانگرهای مورد بررسی در این تحقیق، از نشانگرهایی که قدرت تفکیک و پیوستگی بالایی با صفات مهم زراعی در شرایط تنش خشکی دارند (و درصورتی که در آزمایش های بعدی به تایید برسند)، می توان در برنامه های به نژادی تنش خشکی استفاده نمود.