|
|
ارزیابی تنوع ژنتیکی سنجد با استفاده از نشانگرهای مرفولوژیکی و مولکولی aflp
|
|
|
|
|
نویسنده
|
زیرک رویا ,سلیمانی علی ,زینالعابدینی مهرشاد ,حاتمی ملکی حمید ,خیری عزیزاله
|
منبع
|
پژوهش هاي ژنتيك گياهي - 1397 - دوره : 5 - شماره : 2 - صفحه:41 -54
|
چکیده
|
در این تحقیق تنوع ژنتیکی تعداد 30 ژنوتیپ سنجد متعلق به زیستگاه های استان آذربایجان شرقی (مناطق تبریز، مراغه و ملکان) با استفاده از نشانگرهای مرفولوژیکی و ملکولی aflp ارزیابی شد. نتایج آماره های توصیفی صفات کمی و کیفی بیانگر وجود تنوع در ژرم پلاسم مورد ارزیابی بود. با استفاده از الگوریتم upgma بر پایه صفات کمی و کیفی، ژنوتیپ ها در 5 گروه قرار گرفتند. در گروه اول بیشتر ژنوتیپ های منطقه مراغه و در گروه سوم بیشتر ژنوتیپ های منطقه تبریز قرار گرفتند. از تعداد 14 ترکیب آغازگر ecorimsei برای انگشت نگاری ژنوتیپ ها استفاده شد و در مجموع تعداد 439 نوار چند شکل تکثیر شد. براساس معیار تشابه جاکارد، کمترین شباهت ژنتیکی (25 درصد) بین ژنوتیپ های 19 (منطقه ملکان) و 27 (منطقه مراغه) مشاهد شد. نتایج تجزیه به مختصات اصلی بیانگر پوشش ژنومی مناسب نشانگرهای aflp انتخاب شده در این مطالعه بود. بیشترین مقدار محتوای اطلاعات چندشکل (0.83 درصد) مربوط به ترکیب آغازگری mtttega و کمترین مقدار آن (0.33 درصد) مربوط به ترکیب آغازگری mgt eta بود. تجزیه خوشه ای با استفاده از داده های ملکولی ژنوتیپ ها را در 3 گروه قرار داد. بر این اساس توده هایی با توزیع مناطق جغرافیایی مشابه در کنار هم قرار نگرفتند، لیکن گروه بندی بر اساس صفات مرفولوژیکی کمی و کیفی تا حدود زیادی با توزیع جغرافیایی ژنوتیپ ها همخوانی نشان داد. این نتایج بر اساس نظریه تکامل همگرا و تا حدودی بدلیل تکثیر غیرجنسی سنجد از ژنوتیپ های مادری محدود و توزیع آنها در مناطق جغرافیایی مورد مطالعه، قابل تفسیر می باشد.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، سنجد، صفات کمی، aflp
|
آدرس
|
دانشگاه زنجان, دانشکده کشاورزی, گروه باغبانی, ایران, دانشگاه زنجان, دانشکده کشاورزی, گروه باغبانی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران, ایران, دانشگاه مراغه, دانشکده کشاورزی, گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی, ایران, دانشگاه زنجان, دانشکده کشاورزی, گروه باغبانی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Morphological and AFLP-Based Genetic Diversity Assessment of Elaeagnus angustifolia L.
|
|
|
Authors
|
Zirak Roya ,Soleimani Ali ,Zeinolabedini Mehrshad ,Hatami Maleki Hamid ,Kheiri Azizolah
|
Abstract
|
Genetic diversity among Russian olive genotypes in three different regions of EastAzerbaijan province (includes Tabriz, Maragheh and Malekan) were assessed using morphological and molecular (AFLP) markers. Results of the quantitative and qualitative traits statistics showed a significant genetic variation among studied germplasm and categorized them in five distinguished groups. The most number of genotypes from Maragheh region were in group 1, while, the group 3 consisted of the majority of genotypes from Tabriz region. All genotypes were analyzed with 14 EcoRIMseI primer combinations. A total of 439 informative and polymorph AFLP markers was generated and analyzed. Based on Jaccard Similarity Index, the minimum genetic similarity was observed between genotype 19 (from Malekan region) and 27 (from Maragheh). The principal coordinate analysis (PCoA) showed the suitable genomic distribution of AFLP markers among individuals. The highest (0.83 %) and lowest (0.33 %) polymorphic information content achieved by primers combination MTTTEGA and MGTETA, respectively. Cluster analysis using molecular data and UPGMA algorithm, classified the studied genotypes in three distinguished groups. The genotypes at the same geographical region did not classify in the same group based on clustering by molecular data. However, this achieved to a large extent when they were classified groups using morphological traits. This result might be explained in terms of convergent evolution and some in part due to asexual propagation of Russian olive from the limited maternal genotypes and distribution across the different geographical regions.
|
Keywords
|
Genetic diversity ,Elaeagnus angustifolia ,Quantitative traits ,AFLP ,AFLP
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|