مطالعه شباهت‏های ژنتیکی و روابط تبارشناختی 10 گونه میگوی خانواده penaeidae بر اساس توالی‌های ژنوم میتوکندریایی

میگوهای خانواده penaeidae مهم‌ترین آبزیان پرورشی از گروه سخت‌پوستان هستند که جایگاه اقتصادی مهمی ‌در صنعت آبزی‌پروری جهان کسب کرده‏اند. در این مطالعه، توالی‌های کامل ژنوم میتوکندریایی 10 گونه مهم میگوی خانواده penaeidae همراه با توالی های نوکلئوتیدی و آمینواسیدی 13 ژن رمزگر پروتئین‏ به ازای هر ژنوم از بانک اطلاعاتی ncbi استخراج و با یکدیگر مقایسه شدند. بر اساس ژنوم کامل میتوکندریایی، بیشترین شباهت ژنتیکی (88.5 درصد) بین گونه میگوی سفید هندی و گونه میگوی موزی و کمترین شباهت (76.4 درصد) بین گونه میگوی پشت چرب با گونه میگوی ببری سیاه وجود داشت. در بررسی تبارشناختی ژنوم کامل میتوکندریایی، دو خوشه اصلی در ابتدای درخت تبارنما ایجاد شد. گونه‌های میگوی پشت چرب و سفید سرتیز در یک خوشه اصلی و گونه‏های دیگر در خوشه اصلی دیگر قرار گرفتند. نتایج تبارشناختی توالی‏های نوکلئوتیدی و آمینواسیدی 13 ژن نشان داد که گونه‌های میگوی پشت چرب با سفید سرتیز، میگوی آبی با سفید غربی و میگوی موزی با سفید هندی در زیرخوشه‏های متمایز قرار گرفتند که تاییدی بر نتایج به دست آمده از مقایسه ژنوم کامل میتوکندریایی است. بر اساس نتایج، توالی‌های ژنوم میتوکندریایی می‌توانند برای طیف گسترده‏ای از تجزیه و تحلیل‏های دقیق تبارشناختی و ژنتیکی گونه‌های متفاوت میگو مورد استفاده قرار گیرند.

study of genetic similarities and phylogenetic relationships of 10 penaeidae shrimp species based on the sequences of the mitochondrial genome

penaeidae shrimp species are the most important farmed aquatic animals from the crustacean group which have gained an important economic position in the world’s aquaculture industry. in this study, complete mitochondrial genome sequences along with nucleotide and amino acid sequences of 13 pcgs per each genome from 10 important penaeidae shrimp species were obtained from ncbi database and compared. according to the complete mitochondrial genome, the highest (88.5%) and lowest (76.4%) genetic similarity was found between fenneropenaeus indicus and fenneropenaeus merguiensis, and metapenaeus ensis and penaeus monodon, respectively. in phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome, two main clusters were established at the beginning of the phylogenetic tree. metapenaeus ensis and metapenaeus affinis were placed in one main cluster and other species in another main cluster. the results of the phylogenetic analysis of the nucleotide and amino acid sequences of the 13 pcgs showed that m. ensis and m. affinis, litopenaeus stylirostris and litopenaeus vannamei, and f. merguiensis and f. indicus species were grouped in different clusters, which confirms the results obtained from the comparison of the complete mitochondrial genome. based on the results, mitochondrial genome sequences could be used for a wide range of detailed phylogenetic and genetic analyzes of different shrimp species.