شناسایی سویه هوازی اجباری aeribacillus pallidus gh1 جدا شده از چشمه آب گرم قینرجه در استان اردبیل

نمونه‌های آب از چشمه‏ آب معدنی گرم قینرجه استان اردبیل در اطراف کوه سبلان جمع‏آوری شد. پس از کشت، از میان باکتری‏های رشد داده شده، باکتری gh1 به دلیل رشد سریع‌تر در محیط های انتخابی و بازه دمایی مورد نظر، برای بررسی‎‏های بیشتر انتخاب شد. ویژگی های باکتری با استفاده از کشت روی محیط‌های کشت اختصاصی در شرایط هوازی و بی هوازی، آزمایش‌های بیوشیمیایی، تعیین هویت برخی لیپیدها، تعیین توالی بازی 16s rdna و ترسیم درخت فیلوژنتیک به دست آمد. باکتری gh1، گرم مثبت، اسپوردار و غیرمتحرک بود. طول و عرض سویه 4-3 ×1 میکرومتر بود و اسپورهای آن مستطیل شکل و انتهایی بودند. دمای مطلوب رشد 60-58 درجه سانتی‌گراد و حداقل و حداکثر دمای رشد به ترتیب 30 و 72 درجه سانتی‌گراد بود. ph مطلوب رشد 8.0 بود و باکتری در ph بین 6 تا 10 رشد می کرد. غلظت 15.0/0 درصد nacl سرعت رشد را بالا برد، اما غلظت 2.0 درصد nacl رشد را مهار کرد. تنها منبع هیدروکربنی با اثر مثبت روی رشد باکتری، نشاسته بود. علاوه بر فعالیت آمیلازی، باکتری دارای فعالیت‏های ژلاتینازی، کاتالازی و اکسیدازی نیز بود. سویه gh1 هوازی بود و روی محیط کشت بی هوازی رشد نکرد. بررسی لیپیدهای قطبی نشان داد سویه حامل فسفاتیدیل اتانول آمین، دی‏فسفاتیدیل گلیسرول، فسفاتیدیل گلیسرل و چندین لیپید و فسفولیپید شناسایی نشده بود. دی‏آمینو پیملیک اسید در دیواره‎ باکتری موجود نبود. بررسی توالی 16s rdna نشان داد این توالی 99.72 درصد با  باکتری aeribacillus pallidus یکسانی داشت. ویژگی های مهم دیگر باکتری، مانند تحرک و تنفس بی هوازی، با گزارش های پیشین متفاوت بودند. نتایج به دست آمده همچنین نشان داد که نمی توان از وجود فسفاتیدیل اتانول آمین به عنوان معیاری برای تفکیک aeribacillus از geobacillus استفاده کرد.

Identification of a strictly aerobic Aeribacillus pallidus strain Gh1 from a hot water spring in Gheynarjeh, Ardebil Province

Water samples were collected from Gheynarjeh hot water spring, around Sabalan Mountain in Ardebil province. One isolate (Gh1), isolated from the hot water spring was chosen for further studies. This selection was based on the isolates ability to grow faster and within the temperature limits chosen. Isolate characteristics were determined by culture on various selective aerobic and anaerobic media, biochemical assays, identification of typical lipids, 16S rDNA sequencing and drawing the phylogenetic tree. Isolate Gh1 was 1μm wide and 34μm in length and an endosporeforming nonmotile Gram positive bacillus with rectangular terminal spores. The optimal growth temperature was 5860°C, with Tmin and Tmax at 30°C and 72°C, respectively. The optimal pH for growth was 8.0 and it grew between pH 6 and 10. NaCl concentrations of 0.5–1.0% encouraged growth, but at 2% NaCl, growth was inhibited. The only carbohydrate source with a positive effect on bacterial growth was starch. The isolate exhibited amylolytic as well as gelatinolytic, catalase and oxidase activities. The isolate was aerobic and no growth was observed on anaerobic medium. Cell wall fatty acid analysis showed the presence of phosphatidyl ethanolamine, diphosphatidyl glycerol, phosphatidyl glycerol and several unidentified lipids and phospholipids. Diaminopimelic acid could not be detected in the peptidoglycan. The 16S rDNA sequence analysis exhibited 99.72% identity with Aeribacillus pallidus. Other important characteristics, such as movement and anaerobiosis were different from those previously reported isolates. In addition, the results showed that the presence/absence of phosphatidyl ethanolamine cannot be used as a variable for differentiating between Geobacillus and Aeribacillus.