|
|
|
|
بررسی تنوع لوکوس های صفات کمی (qtls) مرتبط با صفت رشد در بچه ماهیان قزل آلای رنگین کمان پرورشی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
نظری سجاد ,پاک نژاد حامد
|
|
منبع
|
بهره برداري و پرورش آبزيان - 1399 - دوره : 9 - شماره : 2 - صفحه:95 -104
|
|
چکیده
|
جهت اجرای این تحقیق از 30 مولد نر و ماده قزل آلای رنگین کمان استفاده شد. پس از پرورش به مدت شش ماه، استخراج ژنوم از بچه ماهیان صورت پذیرفت. تعداد 4 جفت لوکوس صفت کمی (qtl) در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفت. آنالیزهای مولکولی نشانگرهای qtl نظیر پیوستگی صفتنشانگر (آماره ld) به کمک نرم افزار mapchart 2.1 انجام پذیرفت. آنالیز ارتباط بین ژنوتیپ ها و صفت رشد با استفاده از مدل خطی glmبه کمک نرم افزار spss 21.0 انجام شد. با توجه به نتایج این بررسی هتروزیگوسیتی مشاهده شده (ho) و مورد انتظار (he) در جایگاههای qtl به ترتیب بین 0.699 - 0.354 مربوط به جایگاه omm5140 و 0.836 - 0.568 مربوط به جایگاه omm1268 بدست آمدند. میزان درصد واریانس (pv) نیز برای صفت وزن بدن در سن 30 و 180 روزگی به ترتیب 18.48 و 31.24 محاسبه شد. همچنین در بررسی حاضر اثر اپیستازی معنی داری بین جایگاههای qtl مورد مطالعه، مشاهده نگردید. در بررسی تعادل هاردی واینبرگ نیز در بیشتر جایگاههای مورد بررسی انحراف از تعادل هاردی– واینبرگ را مشاهده شد (p<0.05). با توجه به تنوع جایگاه ژنی کنترل کننده صفات کمی نمونه های قزل آلای رنگین کمان و از طرفی اهمیت شناسایی لوکوس های صفات کمی مرتبط با رشد، لوکوس های صفات کمی مرتبط با صفت مزبور در خانواده های ماهی قزل آلای رنگین کمان را می توان در برنامه های آینده و یا مزارع پرورشی مختلف مورد استفاده قرار داد.
|
|
کلیدواژه
|
قزل آلای رنگین کمان، تنوع ژنتیکی، لوکوس های صفات کمی، بهگزینی
|
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, مرکز تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد ماهیان سردآبی شهید مطهری یاسوج، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده شیلات و محیط زیست, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
hkolangi@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Investigation of quantitative trait loci (QTL) variations for growthrelated traits in farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
|
|
|
|
|
Authors
|
Nazari Sajad ,Paknejad Hamed
|
|
Abstract
|
In this study thirty male and female broodstock of rainbow trout (n=30) for generating full sibling collected in Coldwater Fishes Genetic and Breeding Research Center. We generated 13 different families using factorial mating design. Then juveniles were raised at the ponds until 6 months posthatching. Genome extracted based on standard method and these individuals randomly selected for molecular analysis. Fin clips were cut and specimens were kept at 20̊ C until use. Four specific primers were used for rainbow trout and all the four QTL loci screened in this study were successfully amplified in all families. Statistical analyses including linkage disequilibrium (LD), association between genotypes and two quantitative traits including body weight (BW) and total length (TL) were performed using MapChart 2.1, GDA 1.1. General Linear Model (GLM) was performed with software SPSS 21.0. The results demonstrated the mean observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (HE) varied between 0.354 to 0.699 for locus OMM5140 and 0.568 to 0.836 for locus OMM1268, respectively. No significant epistatic interactions were identified between QTL markers. Proportion of phenotypic variation explained by each QTL (PV) for body weight at age 30 and 180 were 18.48 and 31.24, respectively. HardyWeinberg departure was observed for most loci from all farms and were disequilibrium (p < 0.05). The four QTL loci variation in rainbow trout is important to gain a better understanding of the genetics of production traits and for transferring genetic information and improved selective breeding program to farms in Iran
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|