تنوع ژنتیکی گیاه بیابانی رمس (Haloxylon Salicornicum (Moq.) Bunge Ex Boiss)، در رویشگاه‌های مختلف با استفاده از نشانگر Issr (مطالعه موردی: استان یزد)

گیاه رمس (haloxylon salicornicum (moq.) bunge ex boiss) گونه ای درختچه ای است که در بخش‌های وسیعی از مناطق مرکزی ایران رویش دارد. سازگاری بالای این‌ گونه به شرایط سخت محیطی و اهمیت آن در تثبیت شن، کنترل ریز گردها و کارکردهای دارویی، ایجاب می نماید تا با شناخت تنوع ژنتیکی آن، نسبت به انتخاب ژنوتیپ های برتر اقدام نمود. در این مطالعه تعداد 12 آغازگر مربوط به نشانگر داخلی ریز ماهواره‌ها برای ارزیابی تنوع ژنتیکی 30 ژنوتیپ رمس از سه منطقه جغرافیایی استان یزد استفاده شد. از بین 12 آغازگر تنها 4 آغازگر قادر به تکثیر 39 مکان ژنی با تولید باندهای واضح شدند که تعداد 32 باند، چند شکلی (79.5%) نشان دادند. متوسط میانگین مقادیر ضریب تنوع پذیری نی و شانون به ترتیب 0.451 و 0.643 تعیین گردید. آغازگرهای issr826 با 15 آلل وآغازگر ssr17 با 7 آلل باند به ترتیب بیشترین و کمترین مکان ژنی را تولید نمودند. تعداد آلل ها در هر جایگاه از 7 تا 15 آلل متغیر بود و با میانگین 7.9 محاسبه گردید. با استفاده از آنالیز خوشه‌ای بر مبنای ضریب الگوریتم upgma و ضریب تشابه جاکارد، جدایه‌ها با سطح تشابه 75% در 11 گروه قرار گرفتند. شاخص شانون، تجزیه‌ و تحلیل مولفه‌های اصلی (pcoa) و تجزیه واریانس مولکولی (amova) تفاوت معنی داری بین جداره‌های سه منطقه مشاهده شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد بالاترین مقدار تنوع ژنتیکی (81%) در بین جدایه ها توزیع ‌شده بود و تنوع ژنتیکی درون جدایه های مختلف 19 درصد تعیین گردید. بر پایه نتایج به ‌دست‌ آمده چنین اثبات می شود که تنوع ژنتیکی بالای درون جمعیت ها می تواند به علت توزیع بسیار نزدیک جوامع رمس در نواحی مورد مطالعه باشد.

Investigation of genetic variation in Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss in Different habitats by ISSR Markers (Case study: Yazd)

Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss is a shrub that grows in large parts of the central regions of Iran. Due to the high adaptability of this species to the severe environmental conditions and its importance in the stabilization of sand dunes, Dust control and medicinal functions recognition of its genetic diversity and the selection of superior genotypes is very important. A set of 12 inter simple sequence repeat (ISSR) markers were used to evaluate genetic variation of 30 genotypes from 3 locations in Yazd province. Out of 12 primers, 4 primers were able to produce 39 reproducible bands that out of which, 32 bands were polymorphic (79.5%) with a mean PIC value of 0.39. The number of alleles in each individual locus varied in the range of 715 with the mean of 9.75. Primers ISSR 826 and with 9 alleles and ISSR7 with 7 allels showed the highest and lowest number of loci, respectively. The mean average rate of Nei rsquo;s gene diversity (hchr('39')) and Shannon rsquo;s diversity index (I) were 0.451 and 0.643, respectively Using cluster analysis based on UPGMA algorithm and Jaccardchr('39')s similarity coefficient, the isolates with 45% similarity level were divided into 5 groups. Shanon index, Principal coordinates analysis (PCoA), and analysis of molecular variance (AMOVA) revealed significant difference among isolates selected from three regions. Analysis of molecular variance showed that the highest genetic diversity rate (89%) was disturbed between isolates and genetic variety within different isolated was determined as 11%. Based on these results in this work it can be demonstrated a high genetic diversity within the populations will be due to the closely distributed Haloxylon community in these studied regions.