|
|
بررسی بیوانفورماتیک نقش mirnaها در تنظیم بیان ژنهای دخیل در بلوغ جنسی و تولیدمثل در ماهی گورخری (danio rerio)
|
|
|
|
|
نویسنده
|
بنایی مهدی ,بدر احمدعلی ,وزیرزاده آریا
|
منبع
|
علوم آبزي پروري - 1403 - دوره : 12 - شماره : 1 - صفحه:23 -38
|
چکیده
|
Microrna ها (mirnas) بهعنوان تنظیمکننده های حیاتی بیان ژن شناخته می شوند و تاثیر بهسزایی بر فرآیندهای مختلف زیستی از جمله بلوغ جنسی و تولید مثل دارند. در این مطالعه، از ابزارها و تکنیک های بیوانفورماتیک برای بررسی نقش mirna ها در تنظیم بیان ژن های مرتبط با بلوغ جنسی و تولید مثل ( ghrhra، kiss2، dnd، gh1، sox9a، shbg، fshb، stat3، cyp17a1، cyp19a1b، ar، amh، esr2b، rspo1 و sox21a) در ماهی گورخر (danio rerio) استفاده شده است. در این روش با ادغام پیشبینیهای محاسباتی با دادههای اعتبارسنجی تجربی، شبکههای تنظیمی ژن mirna خاص شناسایی گردید (dre-mir-429a، dre-mir-92a، dre-mir-200b، dre-mir-96، dre-mir-217، dre-mir-155، dre-mir-26a-5p، dre-mir-737، dre-mir-740، dre-mir-737-5p، dre-mir-93، dre-mir-140-3p، dre-mir-15a و dre-mir-144) که در مراحل کلیدی رشد و فرآیندهای فیزیولوژیکی مربوط به بلوغ جنسی و تولیدمثل در ماهی گورخری نقش دارند. یافتههای این مطالعه، بر مکانیسمهای نظارتی پیچیدهای را که توسط mirnaها در تعدیل بیان ژنهای حیاتی برای موفقیت باروری در گورخرماهی تنظیم شدهاند، تاکید میکند و بینشهای ارزشمندی را در مورد اساس مولکولی زیستشناسی تولیدمثل در این ارگانیسم مدل ارائه میدهد. این مطالعه می تواند به درک عمیقتری از شبکههای نظارتی حاکم بر بلوغ و تولیدمثل جنسی ماهی ها کمک کند.
|
کلیدواژه
|
بیوانفورماتیک microrna ها، تنظیم ژن، بلوغ جنسی، تولیدمثل
|
آدرس
|
دانشگاه صنعتی خاتم الانبیا, دانشکده منابع طبیعی, گروه شیلات, ایران, دانشگاه صنعتی خاتم الانبیا بهبهان, دانشکده علوم پایه, گروه زیستشناسی, ایران, دانشگاه شیراز, دانشکده کشاورزی, گروه مهندسی منابع طبیعی و محیطزیست, ایران
|
پست الکترونیکی
|
aryavazirzadeh@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
bioinformatics study of the role of mirnas in regulating the expression of genes involved in sexual maturity and reproduction in zebra fish (danio rerio)
|
|
|
Authors
|
banaee mahdi ,badr ahmad ali ,vazirzadeh arya
|
Abstract
|
micrornas (mirnas) have known as crucial regulators of gene expression, influencing various biological processes such as sexual maturation and reproduction. in this study, the bioinformatics tools and techniques were used to investigate the role of mirnas in regulating the expression of genes (ghrhra, kiss2, dnd, gh1, sox9a, shbg, fshb, stat3, cyp17a1, cyp19a1b, ar, amh, esr2b, rspo1, sox21a) associated with sexual maturity and reproduction in zebrafish (danio rerio). in this study, by integrating computational predictions with experimental validation data, we identified specific mirna-gene (dre-mir-429a, dre-mir-92a, dre-mir-200b, dre-mir-96, dre-mir-217, dre-mir-155, dre-mir-26a-5p, dre-mir-737, dre-mir-740, dre-mir-737-5p, dre-mir-93, dre-mir-140-3p, dre- mir-15a, dre-mir-144) regulatory networks implicated in key developmental stages and physiological processes related to sexual maturation and reproduction in zebrafish. the findings shed light on the intricate regulatory mechanisms orchestrated by mirnas in modulating the expression of genes crucial for reproductive success in zebrafish, providing valuable insights into the molecular basis of reproductive biology in this model organism. this study has the potential to deepen our understanding of the regulatory networks involved in the maturation and sexual reproduction of fish.
|
Keywords
|
bioinformatics ,micrornas ,gene regulation ,sexual maturity ,reproduction
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|