|
|
بررسی تنوع ژنتیکی جنس gammarus در چشمه ها و رودخانه پارک ملی گلستان با استفاده از توالی ژن میتوکندریایی coi
|
|
|
|
|
نویسنده
|
هدایتی راد فائزه ,رضایی حمیدرضا ,خلیلی پور اولیاقلی ,رمضانی جواد ,کاتوزیان احمدرضا
|
منبع
|
علوم آبزي پروري - 1401 - دوره : 10 - شماره : 19 - صفحه:58 -72
|
چکیده
|
گاماروس بزرگترین جنس از سختپوستان آبزی خانواده gammaridea است که بیش از 200 گونه در سراسر جهان دارد. این گروه از سختپوستان اجزای بسیار مهم زنجیره غذایی در آبهای جاری هستند. بنابراین تغییرات جمعیتی آنها میتواند بر جوامع، بهویژه بر سلامت ذخایر ماهیان اثر گذاشته و تعادل اکوسیستم را برهم زند. بهدلیل اندازه نسبتاً کوچک، فراوانی زیاد و حساس بودن به شرایط محیطی، بهعنوان گونههای شاخص برای ارزیابی محیطهای آبی مناسب هستند. این پژوهش، به بررسی تنوع ژنتیکی جنس گاماروس بین جمعیتهای مختلف موجود در پارک ملی گلستان پرداخته است. پس از نمونهبرداری جهت شناسایی ریختی اولیه از کلیدهای شناسایی رایج و جهت انجام مطالعات مولکولی از توالی ژن میتوکندریایی coi استفاده شد. روابط تبارشناختی با روش حداکثر درستنمایی (ml) تعیین شد. فاصله ژنتیکی موجود در جمعیتها و برخی شاخصهای تنوع ژنتیکی (تعداد هاپلوتایپ (h)، تنوع هاپلوتایپ (hd) و تنوع نوکلئوتیدی (pi)) محاسبه شد. بر اساس نتایج درختهای تبارشناسی نمونههای مورد مطالعه در 2 کلاد مجزا قرار گرفتند و با بوتاسترپ بالا (0/92) از نمونههای اخذ شده از ژن بانک جدا شدند. نتایج تجزیه و تحلیل واریانس مولکولی نشان داد که تنوع بین جمعیتها (72/49) بیش از تنوع درون جمعیتها (27/51) است و مقدار شاخص fst (0/68) تفاوت ژنتیکی بارز بین جمعیتها و محدودیت جریان ژن را نشان میدهد. تنوع هاپلوتایپی برابر با 0/94 بود که بیشترین و کمترین آن بهترتیب مربوط به رودخانه خاندوشان (1/00) و چشمه گلستان (40/.) میباشد. همچنین در بین هاپلوتایپهای شناسایی شده 17 هاپلوتایپ فقط دارای یک فرد بودند که این امر بیانگر تنوع بالای جمعیتهای گاماروس در پارک ملی گلستان و وجود جمعیتهای بومی میباشد. g .komareki، بهعنوان یک مجموعه گونهای غالب با گونههای پنهان فراوان در منطقه شناخته شد که هنوز بهطور دقیق شناسایی نشده است.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، جریان ژنی، گلستان، گاماروس
|
آدرس
|
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده شیلات و محیط زیست, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان, دانشکده شیلات و محیط زیست, گروه محیط زیست, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده منابع طبیعی, گروه محیط زیست, ایران, سازمان حفاظت محیط زیست, پژوهشکده محیط زیست و توسعه پایدار, گروه تنوع و ایمنی زیستی, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده علوم, گروه زیستشناسی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
ahmadreza.katouzian@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
investigating the genetic diversity of the genus gammarus in the springs and rivers of golestan national park using the coi mitochondrial gene sequence
|
|
|
Authors
|
hedayati rad faezeh ,rezaei hamidreza ,khalilipour olyagholi ,ramezani javad ,katouzian ahmadreza
|
Abstract
|
gammarus is the largest genus of aquatic crustaceans in the family gammaridea, with more than 200 species worldwide. these crustaceans are very important components of the food chain in running waters. therefore, their population changes can affect all communities, especially the health of fish stocks, and disturb the balance of the ecosystem. due to their small size, high abundance and sensitivity to environmental conditions, they are suitable as indicator species for evaluation. this study investigated the genetic diversity of the genus gammarus between different populations in golestan national park. after sampling, the common identification keys were used to identify the basic morphology and the coi mitochondrial gene sequence was used to conduct molecular studies. genealogical relationships were determined by maximum likelihood (ml) method. the genetic distance in the populations and some indices of genetic diversity (number of haplotypes (h), haplotype diversity (hd) and nucleotide diversity (pi)) were calculated. based on the results of the genealogical trees, the samples were placed in two separate clades (western and central) and separated from the gene bank samples with high bootstrap. the results of molecular variance analysis showed that the diversity between populations (72.49) is more than the diversity within populations (27.51) and the value of fst index (0.68) shows the significant genetic difference between populations and the limitation of gene flow. haplotype diversity is equal to 0.94, the highest and lowest of which is related to khandushan river (1.00) and golestan spring (.40). also, among the identified haplotypes, 17 haplotypes had only one individual, which indicates the high diversity of gammarus populations in golestan national park. also, g. komareki was identified as a dominant species complex with many hidden species in the region that have not yet been accurately identified.
|
Keywords
|
genetic diversity ,gene flow ,golestan ,gammarus
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|