|
|
|
|
ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی اکوتیپ های مختلف هندوانۀ با استفاده از نشانگرهای مولکولی Srap
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عبدلی نسب مریم ,رحیمی مهدی
|
|
منبع
|
يافته هاي نوين در علوم زيستي - 1396 - دوره : 4 - شماره : 3 - صفحه:201 -208
|
|
|
|
|
چکیده
|
تعداد 38 توده و رقم مهم هندوانه از مناطق مختلف کشور جمع آوری و پس از آماده سازی خاک، در مزرعۀ تحقیقاتی در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار کشت شد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی، dna از برگ استخراج و واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از 14 جفت آغازگر srap بهینه شد. تعداد 136 باند چندشکل به دست آمد، که جفت آغازگر em10me4 با تعداد نوزده باند و جفت آغازگرهایem16me4 و em16me4 با تعداد هفت باند به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد باند چندشکل را ایجاد کردند. محتوای اطلاعات چندشکل (pic) در این تحقیق بین 20/0 تا 32/0 و میزان تنوع ژنی براساس شاخص نی از 17/0 تا 28/0 به دست آمد. تجزیۀ تابع تشخیص خطی فیشر نشان داد که روش upgma و با انجام صحت گروه بندی در حدود 90 درصد، مناسب تر از دیگر روش های تجزیۀ خوشه ای است. تجزیۀ خوشه ای براساس روش جاکارد توده های تحت مطالعه را در پنج گروه مجزا قرار داد. تجزیه به مختصات اصلی نشان می دهد که مولفه های اول و دوم 5/92 درصد از تنوع به دست آمده را توجیه می کنند که خود نشان دهندۀ توزیع مناسب نشانگرها در کل ژنوم است.
|
|
کلیدواژه
|
تجزیۀ خوشه ای، تنوع ژنتیکی، Pcr
|
|
آدرس
|
دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته, پژوهشکده علوم محیطی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته, پژوهشکده علوم محیطی, گروه بیوتکنولوژی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation of genetic diversity and classification of watermelon (Citrullus lanatus) ecotypes using SRAP molecular markers
|
|
|
|
|
Authors
|
Abdoli Nasab Maryam ,Rahimi Mehdi
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|