بررسی تنوع ژنتیکی ماهی ساردین رنگین کمان (dussumieria acuta) در خلیج فارس و دریای عمان(محدوده استان استان هرمزگان) با استفاده از ژن coi

در این بررسی 12 نمونه ماهی ساردین رنگین کمان از 6 منطقه جاسک، قشم و بندر لنگه صید گردید. استخراج dna با روش فنل-کلروفرم از بافت باله ماهیان انجام شد. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ساردین رنگین کمان از ژن coi استفاده شد. تکثیر ژنcoi  با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالی های موجود در بانک ژن صورت گرفت. طول 619 جفت باز از محصول واکنش زنجیره پلی مرازی توالی یابی شد. توالی های ژنی نمونه ها با استفاده از نرم افزارهای mega5 و bioedit7  مورد مقایسه قرار گرفتند و میزان همولوژی نمونه ها مشخص گردید. همچنین با استفاده از نرم افزار dnasp5  میزان پلی مورفیسم یا تعداد هاپلوتیپ ها ارزیابی شد.  نتایج این تحقیق نشان داد که در بین نمونه های جمعیت های مختلف ساردین رنگین کمان فاصله ژنتیکی کمی وجود دارد. همچنین تعداد 9 نوع هاپلوتیپ بین نمونه های مورد مطالعه شناسایی گردید. 

study of genetic diversity of dussumieria acuta (valenciennes, 1847) in persian gulf and oman sea (coast of the hormozgan province) using cytochrome oxidase subunit i gene (coi)

in this study 12 specimens were collected from bandar jask, qeshm island and bandare lengeh in hormozgan province. dna extraction was performed using phenol-chloroform method. a partial dna sequence of cytochrome oxidase subunit i gene (coi) was used to evaluate genetic diversity. the sequence of cytochrome oxidase subunit i gene was done using specific primers designed based on sequences registered in ncbi genbank. the diversity of 619 bp of coi was estimated. gene sequencing of samples were compared with using mega5 and bioedit7 software. also, polymorphism or haplotype frequency was evaluated using dnasp7 software. results showed that there was low genetic distance equals to among all population and 9 haplotypes among samples were determined.