دستهبندی و پیشبینی کلاله سهشاخه و چندشاخه زعفران با استفاده از ابزارهای آماری یادگیری ماشینی بدوننظارت
|
|
|
|
|
نویسنده
|
بیکی امیرحسین
|
منبع
|
زراعت و فناوري زعفران - 1393 - دوره : 2 - شماره : 3 - صفحه:199 -204
|
چکیده
|
زعفران یک گیاه تریپلویید و عقیم است که در همه کشورها بهعنوان یک ادویه و گیاه دارویی مورد استفاده قرار میگیرد. کلاله مهمترین قسمت گیاه زعفران میباشد. تاکنون هیچ روش مطمین مولکولی برای شناسایی و پیشبینی گونههای دارای کلاله سه و چندشاخه ارایه نشده است. در این بررسی بر اساس نشانگرهای مولکولی چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته و با استفاده از الگوریتمهای بیوانفورماتیکی مختلف،روشهای جدیدی برای پیشبینی کلاله زعفران ارایه شده است. پنج آلل m131400، m151200، m151100، m10850 و g6500 به عنوان مهمترین دستهبندی کننده با دقت پیشبینی بالا بر اساس مدلهای attribute weighting انتخاب شدند که دارای پتانسیل بالایی برای خوشهبندی و تشخیص کلاله سهشاخه ازچندشاخه هستند. دستهبندی بدون یادگیری بر اساس الگوریتمهای k-means و k-medoids قادر به خوشهبندی صحیح کلاله زعفران هستند. نتایج نشان میدهد که برای اولین بار، روشهای دادهکاوی میتوانند شیوهای بسیار موثر، با دقت و صحت بالای 90 درصد برای تمایز ژنتیکی کلاله سهشاخه از چندشاخه مورد استفاده قرار گیرد. این روشها میتوانند در مکانیابی ژنی و انتخاب به کمک بیومارکرها مورد استفاده قرار گیرند.
|
کلیدواژه
|
چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته ,مارکر مولکولی ,یادگیری ماشینی
|
آدرس
|
دانشگاه قم, استادیارگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم , ایران
|
پست الکترونیکی
|
: amirbeiki@gmail.com
|
|
|
|
|