|
|
مطالعه ساختار جمعیت ماهی خارو باله سفید 1839) chirocentrus nudus (swinson, در سواحل خلیج فارس با روشهای ریختسنجی و dna barcoding
|
|
|
|
|
نویسنده
|
فکراندیش حکیمه
|
منبع
|
آبزيان زينتي - 1403 - دوره : 11 - شماره : 2 - صفحه:17 -29
|
چکیده
|
برای مطالعه ساختار ژنتیکی و ریخت سنجی جمعیت ماهی خارو باله سفید chirocentrus nudus از سه منطقه آبادان، شیف و بندرعباس در سواحل خلیج فارس، از هر ایستگاه 20 عدد و در مجموع 60 قطعه ماهی خارو باله سفید با تور گوشگیر در اردیبهشت ماه 1399 صید گردید. 29 صفت ریختسنجی و 5 صفت شمارشی اندازهگیری گردید. برای مطالعه ژنتیکی به روش [1]dna barcoding از طریق توالییابی ژن سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (coi) نیز قطعهای از باله دمی 6 نمونه ماهی از هر ایستگاه شیف، آبادان و بندرعباس، در اتانول 96 درصد قرار داده شد و به آزمایشگاه منتقل گردید. استخراج dna به روش فنل کلروفروم و با واکنش زنجیرهای پلیمراز با یک جفت پرایمر انجام گرفت. بعد از توالییابی یا بارکد ژن coi ، ردیف کردن توالی ها صورت گرفت. نتایج حاصل از تعیین توالی نشان داد که قطعه تکثیر شده 595 جفت باز طول دارد. ژن coi در ناحیهای که مورد مطالعه قرار گرفته بوده، در تمام نمونهها- مشابه همدیگر بود. همچنین نتایج آنالیز تجزیه به مولفههای اصلی(pca) برای صفات ریختسنجی نشان داد که تعداد 9 عامل با مقادیر ویژه بزرگتر از 1 انتخاب شدند که 56/84 درصد شامل تنوع صفات ریختسنجی است. نمودار پراکنش بر اساس مولفههای اول و دوم، دندروگرام صفات ریختسنجی و ترسیم درخت فیلوژنی با نرم افزار maximum linkhood، neighbor- joining و upgma نشان داد که ماهی خاروباله سفید در شمال خلیج فارس دارای حداقل دو جمعیت است.
|
کلیدواژه
|
خارو باله سفید، ریختسنجی، توالییابی، بارکد ژن coi
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد بوشهر, گروه شیلات, ایران
|
پست الکترونیکی
|
hfekrandish@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
the study of the population structure of the white fin fish chirocentrus nudus (swinson, 1839) in the coasts of the persian gulf with morphometry and dna barcoding methods
|
|
|
Authors
|
fekrandish hakime
|
Abstract
|
in order to study the genetic structure and morphology of the population of the whitefin wolf herring (chirocentrus nudus) from three regions of abadan, shif and bandar abbas on the coast of the persian gulf, 20 specimens from each station and a total of 60 fish were collected using gill-nets in may 2019. 29 morphometric and 5 counting traits were measured. for genetic study using mitochondrial cytochrome oxidase (coi) gene sequencing method, a piece of caudal fin of 6 fish samples from shif, abadan and bandar abbas stations were fixed in 96% ethanol and transferred to the laboratory. dna extraction was done by phenol chloroform and polymerase chain reaction with a pair of primers. after sequencing or coi gene barcode, the sequences were aligned. the results of sequencing showed that the amplified fragment is exactly 595 bp. the coi gene in the region studied is exactly the same in all samples. also, the results of principal component analysis (pca) for morphometric traits showed that 9 factors with eigenvalues greater than 1 were selected, which includes 84.56% of the variation of morphometric traits. the distribution diagram based on the first and second components, dendrogram of morphometric traits and phylogeny tree drawing with maximum likelihood, neighbor-joining and upgma software showed that the whitefin wolf herring has at least two populations in the north of the persian gulf.
|
Keywords
|
whitefin wolf herring ,morphometry ,sequencing ,coi gene barcode
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|