|
|
بررسی و تعیین شناسه (barcode) ماهی کپورمعمولی cyprinus carpio درسواحل جنوبی دریای خزر
|
|
|
|
|
نویسنده
|
لاریجانی محمد ,بختیار رویا ,نوروزی مهرنوش ,فدایی رها
|
منبع
|
علوم و فنون شيلات - 1402 - دوره : 12 - شماره : 3 - صفحه:298 -306
|
چکیده
|
این مطالعه به منظور تعیین شناسه (barcoding)با استفاده از ژن سیتوکروم اکسیداز ماهی کپور معمولی، بین سه استان گلستان، مازندران و گیلان (به ترتیب در مناطق گمیشان، تجن و کیاشهر) در سال1390 انجام شده است. نتایج حاصل از تعیین توالی30 نمونه باله دمی گونه کپور دریایی سواحل جنوبی خزر نشان داد که تمامی نمونه ها از یک گونه بوده و فاصله ژنتیکی آنها حداقل به 2 درصد نمی رسد. بنابراین همه نمونه های کپور سه استان از یک گونه می باشند و از یک نوع بارکد برخوردار می با شند. در بررسی فاصله نوکلئوتیدی و هاپلوتیپی، منطقه گمیشان به ترتیب، 10.75000 ، 1 و منطقه کیاشهر به ترتیب، 3.2000 و 0.9333 بدست آمد. در بررسی تنوع نوکلئوتیدی بین دو منطقه 0.01978 و میانگین اختلاف نوکلئوتیدی 12.187 بدست آمد. تنوع هاپلوتیپی در منطقه گمیشان 38.095 و در منطقه کیاشهر 23.809 درصد محاسبه شد. از مجموع 13 هاپلوتیپ، منطقه گمیشان با 8هاپلوتیپ (61.53 درصد) و منطقه کیاشهر با 5 هاپلوتیپ (38.46 درصد) از کمترین مقدار هاپلوتیپ برخوردار بودند. نتایج این بررسی نشان می دهد که بین نمونه های کپور دریایی دو منطقه گمیشان و کیاشهر از نظر تنوع نوکلئوتیدی و هاپلوتیپی اختلاف معنی داری وجود دارد (p<0.05).
|
کلیدواژه
|
بارکد، کپورمعمولی، تنوع نوکلئوتیدی و هاپلوتیپی، دریای خزر
|
آدرس
|
مرکز تحقیقات ذخایر آبزیان ابهای داخلی, ایران, دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی, گروه علوم دامی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد تنکابن, ایران, دانشگاه جیرفت, دانشکده منابع طبیعی, گروه مهندسی شیلات, ایران
|
پست الکترونیکی
|
raha.fadai@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
investigation and identification of barcode of common carp cyprinus carpio in the southern coast of the caspian sea
|
|
|
Authors
|
larijani mohamad ,bakhtiar roya ,norouzi mehrnoush ,fadaei raha
|
Abstract
|
this study was performed to determine the identification (barcoding) using cytochrome oxidase gene of common carp, between three provinces of golestan, mazandaran and gilan (respectively in gomishan, tajan and kiashahr) in 2011. the results of sequencing showed that all samples from the three regions had a genetic distance less than 2%, so all samples were from the same species. the results of sequencing 30 tail samples of carp species on the southern shores of the caspian sea showed that all samples are of the same species and their genetic distance does not reach at least 2%. therefore, all carp samples of the three provinces are of the same species and have the same type of barcode. in the study of nucleotide and haplotypic distance, gomishan region was 10.75000, 1 and kiashahr region were 3.200 and 0.9333, respectively. in the study of nucleotide diversity between the two regions, 0.01978 and the average nucleotide difference was 12.187. haplotypic diversity in gomishan region was 38.095 and in kiashahr region was 23.809%. out of 13 haplotypes, gomishan region with 8 haplotypes (61.53%) and kiashahr region with 5 haplotypes (38.46%) had the lowest haplotypes.the results of this study show that there is a significant difference between carp samples in gomishan and kiashahr regions in terms of nucleotide and haplotypic diversity (p <0.05).
|
Keywords
|
barcode ,common carp ,nucleotide and haplotype diversity ,caspian sea
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|