شناسایی مولکولی چهار گونه از شکم پایان سواحل صخره‌ای خلیج‌فارس

در این پژوهش شناسایی مولکولی چهار گونه از شکم پایان در آب های ساحلی خلیج‌فارس موردبررسی قرار گرفت. بدین منظور از ژن های میتوکندریایی coi و s rrna16 استفاده شد. نمونه برداری در مهرماه 1392 و اردیبهشت و دی‌ماه 1393 در سواحل صخره ای شمال خلیج فارس انجام گرفت و نمونه ها مورد شناسایی مورفولوژیک قرار گرفتند و گونه های planaxis sulcatus، cerithidea cingulata، siphonaria savignyi و onchidium peronii شناسایی شدند. سپس مراحل استخراج dna با استفاده از پودر chelex و پروتئیناز k، تکثیر قطعه ژنی زیر واحد i سیتوکروم اکسیداز (coi) و s rrna16 انجام و توالی یابی شدند. درمجموع 6 توالی coi و 3 توالی s rrna16 متعلق به این گونه ها برای اولین بار از منطقه شمالی خلیج فارس گزارش و در بانک ژن به ثبت رسید. آنالیزهای فیلوژنی با استفاده از نرم افزارهای mega6 و paup و با رسم درخت های فیلوژنی maximum likelihood وmaximum parsimony صورت گرفت. بررسی مولکولی این گونه ها نتایجی مطابق با شناسایی مورفولوژیک نشان داد. هر دو قطعه میتوکندریایی در شناسایی تا سطح گونه کارآمد عمل کردند. در این پژوهش دو نوع درخت ml و mp رسم شده برای نمونه ها و آنالیزهای مولکولی با شناسایی مورفولوژیک انجام‌شده، نتایج یکسانی نشان داد. همچنین نتایج مشابهی از بررسی نشانگرهای coi وs rrna16 حاصل شد و تفاوتی در توپولوژی درخت های فیلوژنی رسم شده و نیز نتایجی که از تفسیر آن ها استنباط شد، مشاهده نشد. بالا بودن شاخص های حمایتی گره های پایه در آنالیزهای انجام‌شده، اثباتی بر آن است که قطعه ژنی coi، نشانگری مطلوب برای ارزیابی و حل فرضیه های تکاملی می باشد.

The Molecular Identification of four Species of Gastropoda on Rocky Shores of the Persian Gulf

In this study molecular identification of four species of Gastropoda have been studied based on mitochondrial genes, COI and 16S rRNA in the present work for the first time in the northern rocky coastal zones of Persian Gulf during years 2013 and 2014. Planaxis sulcatus، Cerithidea cingulata، Siphonaria savignyi and Onchidium peronii Identified. After morphological identification, DNA extraction, amplifying partial of cytochrome oxidase COI and 16S rRNA and sequencing procedure were done in the laboratory. In this study 6 COI and 3 16S rRNA sequencing belonging to these species were measured and reported for the first time. Also, phylogeny analyses with drawing phylogeny trees of Maximum Likelihood and Maximum Parsimony were done using MEGA6 and PAUP softwares. The result showed that molecular and morphological studies have the same results for this species. Also sequences from both COI and 16S rRNA did not show difference in identification and topology of phylogeny trees.