|
|
|
|
تحلیل بیوانفورماتیکی شبکههای ژنی و تحلیل مسیر رونویسی کبد چرب غیرالکلی در پاسخ به تمرین ورزشی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عاشقی زهرا ,مرندی محمد
|
|
منبع
|
نشريه فيزيولوژي ورزش و فعاليت بدني - 1403 - دوره : 17 - شماره : 4 - صفحه:115 -138
|
|
چکیده
|
بیماری کبد چرب غیرالکلی (nafld) از شایعترین علل اختلال عملکرد کبد است و شیوع آن بهطور چشمگیری افزایش یافته است. بر پایه پژوهشهای انجامگرفته فعالیت بدنی ضمن افزایش بیان پروتئینهایی مانند pparα با افزایش هزینه انرژی سبب کاهش انباشت چربی در کبد میشود و از این راه بر nafld تاثیر میگذارد. هدف پژوهش حاضر، شناسایی ژنهای حیاتی و مسیرهای کلیدی وابسته به nafld و بررسی شبکههای ژنی درگیر در این بیماری، بههمراه تاثیر فعالیت ورزشی بر این مسیرهاست. همچنین تحلیلهای بیوانفورماتیکی انجامگرفته به شفافسازی ارتباطات و تعاملات میان این ژنها و مسیرها کمک میکند. مسیرها را با استفاده از دادههای رونویسی تحلیل و ژن هاب درگیر در مسیرهای وابسته به nafld تعیین کردیم. تجزیهوتحلیل خوشه شبکه نتیجه تجزیهوتحلیل go و کیوتو دایرهالمعارف ژن و ژنوم (kegg) را تایید کرد. ژنهای کشفشده fasn, acox1, srebf1-c, ppara هستند که در فرایندهای بیماریزایی یا مقاومت در برابر nafld نقش دارند. نتایج این پژوهش فهرستی از ژنهای هاب، مسیرهای مهم و بینشهای جدید برای توسعه آتی درمان nafld ارائه کرده و سازوکار اساسی پاسخ کبد را به فعالیت ورزشی روشن میکند.
|
|
کلیدواژه
|
بیوانفورماتیک، تعامل پروتئین-پروتئین، شبکههای ژنی، کبد چرب غیرالکلی، فعالیت ورزشی
|
|
آدرس
|
دانشگاه اصفهان, دانشکده علوم ورزشی, گروه فیزیولوژی ورزشی, ایران, دانشگاه اصفهان, دانشکدة علوم ورزشی, گروه فیزیولوژی ورزشی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
smmarandi2001@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
bioinformatic analysis of gene networks and transcriptional pathway analysis of non-alcoholic fatty liver disease (nafld) in response to exercise training
|
|
|
|
|
Authors
|
asheghi zahra ,marandi mohammad
|
|
Abstract
|
nonalcoholic fatty liver disease (nafld) is one of the most common causes of liver dysfunction, and its prevalence has increased significantly. based on the research conducted, physical activity while increasing the expression of proteins such as peroxisome proliferator-activated receptor alpha (pparα) with increasing energy consumption causes a decrease in the accumulation of fat in the liver and thus affects nafld. the goal of the present study is to identify critical genes and key pathways associated with nafld, and to analyze the gene networks involved in this disease, alongside the impact of exercise on these pathways. furthermore, bioinformatics analyses have been conducted to clarify the interactions between these genes and pathways. we determined the pathways by using the analyzed transcriptional data and hub genes involved in nafld-related pathways. network cluster analysis confirmed the result of gene ontology (go) and kyoto encyclopedia of genes and genomes (kegg) analysis. the discovered genes are fatty acid synthase (fasn), acyl-coa oxidase 1 (acox1), sterol regulatory element-binding transcription factor 1 (srebf1-c), pparα, which are involved in the processes of pathogenesis or resistance to nafld. the results of this study provide a list of hub genes, important pathways and new insights for the future development of nafld treatment and elucidate the underlying mechanism of liver response to exercise.
|
|
Keywords
|
bioinformatics ,protein-protein interaction ,gene networks ,non-alcoholic fatty liver ,exercisehow to cite this article: asheghi z ,marandi m. bioinformatic analysis of gene networks and
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|