|
|
ngs در خدمت ارتقای پزشکی شخصمحور: گزارش موردی یک بیمار مبتلا به سرطان پستان تهاجمی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
میرصادقی لیلا ,حاجی حسینی رضا ,بنایی مقدم علی محمد ,کاوسی کاوه
|
منبع
|
زيست شناسي جانوري تجربي - 1400 - دوره : 10 - شماره : 3 - صفحه:63 -74
|
چکیده
|
ظهور پزشکی شخصمحور با تکیهبر تکنیکهای مولکولی، از جمله ترادفیابی نسل بعدی، درک ما را از محرکهای موثر بر بیماریهای پیچیده، از جمله سرطان افزایش داده است. در بسیاری از موارد به دلیل پیچیدگی سرطان، تصمیمگیری فقط بر اساس اقدامات بالینی یا شواهد آزمایشگاهی برای پزشکان و زیستشناسان امری دشوار است. بنابراین، رویکرد پزشکی شخصی وارد عمل میشود و دادههای انبوه و ارزشمندی را در اختیار متخصصان قرار می دهد. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل دادهها با ابزارهای بیوانفورماتیک، افق جدیدی را در روند پیشآگهی و غربالگری افراد در معرض خطر گشوده است. این امر باعث پیشرفتهای چشمگیر اخیر در فناوری تشخیص شده و درمانهای هدفمند را بهبود بخشیده است. در مطالعه حاضر، نمونه بایگانیشده از بافت تثبیت شده با فرمالین و جاسازی شده در پارافین مربوط به یک بیمار زن ایرانی مبتلا به سرطان پستانِ تهاجمی بهطور موردی بررسی شد. به این ترتیب که پس از استخراج و خالصسازیdna ، ترادفیابی کل اگزوم انجام شد و دادههای جهش مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. اطلاعات به دست آمده میتواند به غنی سازی پایگاههای داده ژنوم ایرانی کمک کند. در پرتو این پژوهش و با مطالعه نمونههای ایرانی بیشتر، ما میتوانیم یک نقشه راه بهینه برای زیستشناسان پژوهشگر در حیطه سرطان و آنکولوژیستهای دقیق ارائه دهیم تا امید به زندگی بیماران مبتلا به سرطان پستان افزایش یابد.
|
کلیدواژه
|
بیوانفورماتیک، پزشکی شخصمحور، ترادفیابی نسل بعدی، دادههای جهش، کارسینومای پستان تهاجمیشده
|
آدرس
|
دانشگاه پیام نور, دانشکده علوم, گروه بیولوژی, ایران, دانشگاه پیام نور, دانشکده علوم, گروه بیولوژی, ایران, دانشگاه تهران, مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک (ibb), گروه بیوشیمی، آزمایشگاه ژنومیکس و اپیژنومیکس (lge), ایران, دانشگاه تهران, مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک (ibb), گروه بیوانفورماتیک، آزمایشگاه سیستمهای زیستی پیچیده و بیوانفورماتیک (cbb), ایران
|
پست الکترونیکی
|
kkavousi@ut.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NGS Serves to Promote Personalized Medicine: A Case-Report of a Patient with Invasive Breast Carcinoma
|
|
|
Authors
|
Mirsadeghi Leila ,Haji Hosseini Reza ,Banaei Ali Mohammad ,Kavousi Kaveh
|
Abstract
|
The emergence of personalized medicine based on molecular techniques, such as nextgeneration sequencing, has increased our understanding of drivers of complex diseases, including cancers. In many cases due to the complexity of cancer, it is difficult for human physicians and biologists to make decisions on the basis solely of clinical practice or laboratory evidence. Thus, the personalized medicine approach comes into play and provides large volumes and valuable data for experts. Further, data analysis with bioinformatic tools has opened a new horizon in the process of prognosis and screening of in risk individuals. It has caused significant recent advances in diagnostic technology and improved targeted treatments. In the present study, archived formalinfixed paraffinembedded tissue from an Iranian female patient with invasive breast carcinoma was investigated. In this way, after DNA extraction and purification, the whole exome was sequenced and the mutation data were analyzed. Obtained information could help to the enrichment of the Iranian genome databases. In the light of this research and by studying other Iranian samples, we can provide an optimized roadmap for precision oncologists to increase the life expectancy of breast cancer patients.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|