شناسایی ژن‌های فیمبریایی و ژن‌های ‏مقاومت به فلوروکینولون‌ها و ‏بتالاکتامازهای وسیع الطیف ‏‎(esbl)‎‏ در ‏اشریشیا کلی‌های جدا شده از مدفوع ‏گاومیش در استان آذربایجان‌غربی

مطالعه حاضر با هدف شناسایی ژن های فیمبریایی، ژن های مقاومت به فلوروکینولون ها و بتالاکتامازهای وسیع الطیف  انجام شد. از تعداد 384 گاومیش از مناطق مختلف استان آذربایجان غربی و در فصول مختلف به‌صورت تصادفی نمونه های مدفوع جمع آوری گردید. شناسایی باکتری اشریشیا کلی در نمونه های مدفوع با استفاده از روش های کشت و بیوشیمیایی انجام گرفت. روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) و با استفاده از جفت پرایمرهای اختصاصی، حضور ژن های فیمبریایی (fima، crl، csga)، ژن tsh، ژن های مقاومت به فلورکینولون ها (qnra، qnrb، qnrs) و ژن های مقاومت به بتالاکتامازهای وسیع‌الطیف (blashv،blatem ، blactxm9) مشخص گردید. از 384 نمونه مدفوع جمع آوری شده از تعداد 115 (9/29 %) نمونه باکتری اشریشیا کلی شناسایی و جداسازی گردید. آلودگی به اشریشیا کلی در شمال استان به طور معنی داری کمتر از جنوب و مرکز استان بود و اختلاف معنی داری از نظر الودگی گاومیش ها به اشریشیا کلی در فصول مختلف وجود نداشت (05/0p<). فراوانی ژن های فیمبریایی fima، crl و csga به ترتیب 1/79%، 1/72%، 7/74% بود و ژن tsh دارای کمترین فراوانی (2/18%) در جدایه های اشریشیا کلی بودند. در بین ژن های مقاومت به فلورکینولون ها و بتالاکتامازهای وسیع الطیف ژن qnrs دارای کمترین فراوانی (0/6%) و ژن blatem دارای بیشترین فراوانی (9/13%) بود. نتایج به‌دست آمده در این مطالعه حضور باکتری اشریشیا کلی را در نمونه های مدفوع کمتر از یک سوم گاومیش‌های نمونه برداری شده نشان داد. ژن های فیمبریایی تقریباً دارای فراوانی مشابهی بودند و ژن های مقامت آنتی‌بیوتیکی در کمتر از 14% جدایه های اشریشیا کلی در گاومیش حضور داشتند. ارزیابی حضور ژن‌های مقاومت آنتی بیوتیکی در جدایه های باکتریایی با منشا حیوانی می تواند از نظر اپیدمیولوژیک و بهداشت عمومی اهمیت زیادی داشته باشد.

Identification of Fimbrial genes and ‎floroquinolons and extended spectrum ‎beta lactamase resistant gene in ‎Escherichia coli isolated from buffalo in ‎west Azerbaijan

The present study aimed to identify fimbria, fluroquinolone and extendedspectrum betalactamase (ESBLs) resistant genes in Escherichia coli isolated from buffalo feces. In this study, a number of 384 buffalo feces from different regions of west Azerbaijan and in different seasons were randomly collected. Fecal samples were cultured and E. coli were investigated using biochemical method. Polymerase chain reaction was employed to identify fimbria genes (fimA, crl and csgA), tsh gene, floroqinulone (qnrA, qnrB, qnrS) and extendedspectrum betalactamase (blaSHV, blaTEM, blaCTXM) resistance genes. A number of 115 (29.9%) fecal samples were positive for E. coli. The frequency of the positive fecal for E. coli from northern region were significantly lower than central and southern regions (P<0.05). The frequency of positive fecal samples for E. coli did not differ between seasons.  The frequency of fimbria genes fimA, crl and csgA were 79.1%, 72.1% and 74.7% respectively. tsh gene had the lowest frequency in E. coil isolates. Among fluroquinolone and extendedspectrum betalactamase resistance genes, qnrS gene had the lowest (6.0%) and blaTEM had the highest (13.9%) frequencies. The results revealed that E. coli was isolated from less than one third of fecal samples. Fimbria genes had almost similar frequencies among E. coli isolates and antibiotic resistance genes were exist in less than 14% of E. coli isolates from buffalo feces. The investigation of antibiotic resistance genes in E. coli originated from animals is of great epidemiological and public health importance.