|
|
نشانگرهای rapd وسیلهای برای مشخص کردن روابط ژنتیکی گیاه چای در ایران
|
|
|
|
|
نویسنده
|
فلکرو کوروش ,جهانگیرزاده خیاوی شاهین ,غلامی مهران ,پور عزیزیان سیاوش
|
منبع
|
پژوهشهاي گياهي - 1401 - دوره : 35 - شماره : 1 - صفحه:175 -189
|
چکیده
|
یکی از مهمترین محصولات شمال ایران که امروزه بسیاری از آنها در معرض از بین رفتن قرار دارند چای (camellia sinensis) میباشد. در این بررسی تعداد 60 اکسشن با استفاده از 24 نشانگر rapd بررسی شدند. نشانگرهای مورد استفاده 219 نوار تکثیر نمود که 81.28 % آنها چندشکلی نشان دادند. میزان محتوای اطلاعات چند شکلی برای تمام نشانگرها از 0.29 الی 0.50 محاسبه شد. میزان محتوای اطلاعات چند شکلی کل نشانگرها نیز 0.49 محاسبه شد که نشان از کارایی بالای نشانگرهای بکار رفته جهت بررسی موجود دارد. ماتریس تشابه تشکیل شده بر اسلاس ضریب جاکارد مابین اکسشنهای مورد مطالعه 0.43-0.94 با میزان متوسط 0.65 بود. بر اساس تجزیه کلاستر نمونهها در تشابه 0.61 به سه گروه تقسیم شدند که گروه دوم خود در تشابه 0.65 به سه زیرگروه تفکیک شد. نکته قابل اهمیت در این تجزیه کلاستر عدم پیروی نمونهها از الگوی جغرافیایی است. در تجزیه بایپلات نیز نتایج مشابهی مشاهد شد. در بررسی میزان تشابه و فاصله ژنتیکی جمعیتهای مورد بررسی مشخص گردید که دامنه تشابه ژنتیکی مابین جمعیتهای چای ایران 0.919-0.950 میباشد که نتیجه این اعداد بیان میدارد تشابه ژنتیکی بالایی مابین جمعیتها وجود دارد. بطور کلی نتایج بدست آمده از این بررسی بیان نمودند که زمانی که نمونهها بصورت مستقیم با یکدیگر مقایسه میگردند تنوع بالایی را نشان میدهند اما زمانی که بصورت جمعیتی آنها را بررسی نماییم، مشخص میگردد که تنوع مابین جمعیتها کم است که دلیل آن به نحوه تکثیر و گرده افشانی آزاد بوتههای چای و تعداد بوتههای اولیه وارد شده باز میگردد.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، نشانگر rapd، میزان محتوای اطلاعات چند شکلی، بای-پلات، گیاه چای
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات علوم باغبانی، پژوهشکده چای, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, پژوهشکده چای، موسسه تحقیقات علوم باغبانی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان گیلان, بخش تحقیقات علوم زراعی-باغی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, پژوهشکده چای، موسسه تحقیقات علوم باغبانی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
shahjahan25862@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
rapd markers, instruments for determining the genetic relationships of tea plant in iran
|
|
|
Authors
|
falakro koorosh ,jahangirzadeh khiavi shahin ,gholami mehran ,pour azizan siavash
|
Abstract
|
one of the important crop in the north of iran that now many of them are at risk of disappearing, is tea plant (camellia sinensis). in this study 60 accessions using 24 rapd markers were investigated. used rapd markers amplified 219 bands that 81.28% of them showed polymorphic pattern. polymorphic information content (pic) were calculated for all markers (0.29-0.50). total calculated pic for all markers was 0.49 that evidenced the usefulness and high level of efficiency of used markers for investigating the diversity of available accessions. the pairwise similarity coefficient between the accessions varied from 0.43 to 0.94 whit average 0.65 by using jaccard’s coefficient. according to cluster analysis samples were divided into three main groups at 0.61 similarity and second group also created three sub-group (at 0.65 similarity). the notable point in this cluster analysis is that the samples did not follow the geographical pattern. similar result was observed in bi-plot analysis. in comparing the similarity and genetic distance of the studied populations, it was found that there is a high genetic similarity between the tea populations in iran (0.919-0.950). in general, the results of this study showed that when the samples are compared individually, they show high diversity, but when we compared them demographically, it is clear that the diversity between the populations are low due to the way propagation, cross-pollination of tea plants and the number of imported primary plants are restored.
|
Keywords
|
camellia sinensis ,genetic diversity ,rapd marker ,polymorphic information content ,bi-plot
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|