|
|
|
|
شناسایی برخی گونه های کاردامینه در ایران با استفاده از نشانگر ملکولی its
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
قربانی مرغشی محمود ,باقری هدایت ,غلامی منصور
|
|
منبع
|
پژوهشهاي گياهي - 1398 - دوره : 32 - شماره : 1 - صفحه:183 -193
|
|
چکیده
|
جنسcardamine l. از خانواده brassicaceaeبا بیش از 200 گونه در جهان و 7 گونه در ایران با توجه به تنوع کاریولوژی و مورفولوژی بالا، گیاه مناسبی برای بررسی های فیلوژنتیکی و تکامل می باشد. گونه کاردامینه هیرسوتا از این جنس بتازگی بعنوان گیاهی مدل در مطالعات مقایسه ای تکاملی معرفی شده است. این گیاه از هفت منطقه مختلف ایران جمع آوری و پس از استخراج dna ی برگی، ناحیه its آنها با استفاده از پرایمر های its4 وits5 تکثیر و سپس تعیین توالی گردید. توالی ها با استفاده از نرم افزار مگا 7 مورد آنالیر فیلوژنتیک قرار گرفتند و از طریق مقایسه نتایج بلاست و درخت فیلوژنتیکی، گونه های c.hirsuta c.flexuosa, c.tenera,و c.uliginosa شناسایی گردیدند. همچنین با استفاده از دو اکوتیپ اروپایی مشخص از گونه هیرسوتا به عنوان شاهد (آزروس و اکسفورد تهیه شده از موسسه ماکس پلانک)، نتایج حاصل تایید گردید. یافته های این پژوهش، علاوه بر تایید حداقل چهار گونه کاردامینه در ایران، کارآمدی نشانگر its را در تفکیک گونه های مختلف جنس کاردامینه بخوبی نشان داد.
|
|
کلیدواژه
|
کاردامینه، نشانگر its، آنالیز فیلوژنتیکی
|
|
آدرس
|
دانشگاه بوعلی سینا, دانشکده کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه بوعلی سینا, دانشکده کشاورزی, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه بوعلی سینا, دانشکده کشاورزی, گروه باغبانی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Identification of some Iranian Cardamine species using the ITS molecular marker
|
|
|
|
|
Authors
|
Ghorbani Marghashi Mahmood ,Bagheri Hedayat ,Gholami Mansour
|
|
Abstract
|
The genus Cardamine L. in Brassicaceae comprises about 200 species in the world and 7 species in Iran. It has great morphological and karyological diversity and complex evolutionary history. This plant was collected from six different parts of Iran. The identity of these species was further explored by DNA extraction from young leaves and amplification of the nuclear ribosomal DNA (nrDNA) internal transcribed spacer (ITS) region by ITS4 and ITS5 primers. The amplified DNA was sequenced via Takapozist Company. Phylogeny reconstructions were performed using MEGA7 software. Blast and phylogeny analysis identified the collected plants as C.hirsuta C.flexuosa, C.tenera and C.uliginosa. Two known europian ecotypes of C. hirsuta (azureus and oxford from Max Planck Institute) were used as control which confirmed the outcome. These results not only confirmed the presence of at least four Cardamine species in Iran but also showed the effectiveness of ITS marker in identification of different species in the genus Cardamine.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|