>
Fa   |   Ar   |   En
   پیشگویی عملکرد اتّصال پروتیینها به ریبونوکلییک اسید بر اساس خواص فیزیکوشیمیایی آنها به کمک روش لوژستیک رگرسیون  
   
نویسنده پورشیخعلی اصغری مهدی ,عبدالمالکی پرویز
منبع پژوهشهاي سلولي و ملكولي - 1394 - دوره : 28 - شماره : 1 - صفحه:45 -53
چکیده    بار، ممان دوقطبی و مقادیر ویژه ممان چهارقطبی به عنوان خواص فیزیکوشیمیایی برای پیشگویی عملکردِ اتّصال پروتیینها به ریبونوکلییک اسید در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند. از روش ساده و کارآی لوژستیک رگرسیون برای انجام عمل پیشگویی استفاده شد. در معادله لوجیت حاصل، پارامتر بار بیشترین ضریب (19/19) و بیشترین تاثیر را در پیشگویی داشت و بعد از آن پارامتر ممان دوقطبی اهمیت داشت. روش لوژستیک رگرسیون به صورت jackknife بر روی 2601 پروتیین (160 پروتیین متّصل شونده به ریبونوکلییک اسید و 2441 پروتیین غیر متّصل شونده به ریبونوکلییک اسید) آموزش داده شد. مقدار پارامتر ارزیابیِ مساحت زیر منحنی roc (auc ) مدل نهایی، 83 درصد به دست آمد که در قیاس با روش شبکه عصبی به کار رفته برای پیشگویی خیلی بیشتر می باشد. مقادیر پارامترهای دقت، صحت و معیار f نیز به ترتیب 94، 59 و 46 درصد به دست آمدند که همگی بیشتر از مقادیر حاصل از روش شبکه عصبی می باشند. در نتیجه، در این تحقیق نشان داده شد که به کمک روش ساده، سریع و دقیقِ لوژستیک رگرسیون، پروتیینهای متّصل شونده به ریبونوکلییک اسید می توانند به خوبی از پروتیینهای غیر متّصل شونده به ریبونوکلییک اسید (به کمک تعداد اندکِ خواص پیشگوی فیزیکوشیمیایی) متمایز شوند.
کلیدواژه پروتیینهای متّصل شونده به ریبونوکلییک اسید ,خواص فیزیکوشیمیایی پروتیینها ,لوژستیک رگرسیون ,پیشگویی عملکرد پروتیین
آدرس دانشگاه تربیت مدرس, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, ایران
 
 

Copyright 2015
Islamic World Science Citation Center
All Rights Reserved