شناسایی و مقدار سنجی نسبی تغییرات پروتئوم مبتنی بر اشک متاٌثر از بیماری قوز قرنیه

قوز قرنیه حالتی نامتقارن از نازک شدن قرنیه است که بطور معمول در سنین نوجوانی بروز کرده و میزان شیوع آن حدود 1 نفر در هر 2000 نفر از جمعیت انسانی می‌باشد. به منظور آشکارسازی تغییرات فراوانی پروتئین‌های نمونه‌ی اشک میان دو گروه بیمار و شاهد، مقدارسنجی پپتیدهای حاصل از هضم پروتئولیتیکی پروتئین‌ها، بدون نشاندار کردن آنها با استفاده از استراتژی الکتروفورز ژلی یک بعدی و کروماتوگرافی مایع-طیف سنجی جرمی متوالی انجام شد. نتایج حاصل از آنالیز آماری نشان داد که از میان 42 پروتئینی که بیان آنها بطور متمایزی متاٌثر از قوز قرنیه تغییر کرده بود، به ترتیب 28 و 14 پروتئین کاهش و افزایش سطح بیان نشان دادند. بر اساس نتایج حاصل شده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی مانند آنالیز هسته شناسی ژنی فرآیندهای زیستی که بطور عمده‌ای در اثر تغییرات سطح بیان این زیر مجموعه از پروتئین‌ها در آسیب شناسی بیماری درگیر می‌شوند شامل: فرآیندهای سلولی ( % 27/1)، فرآیندهای متابولیکی (% 20/2)، تنظیم زیستی (% 11/6)، سازماندهی اجزای سلولی (%9/3) و پاسخ به محرک‌ها (%9/3) هستند. علاوه بر این، آنالیز هسته شناسی ژنی مرتبط با جایگاه سلولی این پروتئینها حاکی از این است که گروه عمدهای از آنها به فضای درون سلولی تعلق دارند.این قبیل مطالعات پروتئومیک، می توانند به ارتقای دانش پایة ما در حوزة فرآیندهای زیستی کمک کرده و درکی عمیق تر از مکانیسم های زمینه ساز بیماری ها بدهند

identification and relative quantification of differential tear-based proteome alterations affected by keratoconus

keratoconus is an asymmetric condition of progressive corneal thinning that typicallyoccurs in early adolescence and has an estimated prevalence of about 1/2,000 in humanpopulation. aimed at revealing alterations in the abundances of tear sample proteinsbetween two patient and control groups, label free quantification of peptides derivedfrom proteolytic digestion of proteins was performed using one-dimensional gelelectrophoresis and liquid chromatography-tandem mass spectrometry strategy. theresults obtained from statistical analysis, to find differentially expressed proteins,showed that 28 and 14 proteins indicated decrement and increment in their expressionlevels, respectively. based on the results of the gene ontology analysis, the biologicalprocesses that are mainly involved in the pathology of the disease in association withexpression level alterations of the above mentioned subset of proteins, comprise cellularprocesses (27.1%), metabolic processes (20/2%), biological regulation (11/6%), cellularcompartment organization (9/3%) and response to stimuli (9/3%). moreover, geneontology analysis associated with the cellular localization of these proteins indicatedthat a large number of them belong to the intracellular space. such proteomics studiescan help us to improve our basic knowledge in the field of biological processes andprovide a deeper understanding of the underlying mechanisms of the diseases.