بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های گونه مریم نخودی (teucrium polium) در غرب ایران با استفاده از نشانگر مولکولی scot

مریم نخودی (l. teucrium polium) از قدیمی‌ترین گیاهان دارویی می‌باشد که در طب سنتی کاربرد فراوان دارد. جهت تعیین میزان تنوع ژنتیکی بین ژنوتیپ‌های مختلف مریم نخودی 17 ژنوتیپ‌ از این گونه با استفاده از 15 آغازگر scot مورد بررسی قرار گرفت که 11 آغازگر دارای باندهای قابل امتیاز‌دهی بودند. آغازگرهای scot در مجموع توانستند 48 باند چند شکل تولید کنند. میانگین تعداد باند تولید شده توسط هر آغازگر برای 17 ژنوتیپ برابر 2.82 بود. آغازگرهای sc20، sc21 و sc59 با 6 باند بیشترین تعداد و آغازگر sc15 با 2 باند کمترین تعداد باند را تکثیر نمود. میانگین درصد چند شکلی (ppb%)، محتوای اطلاعات چند شکلی (pic)، شاخص نشانگری (mi)، شاخص نسبت چندگانه موثر (emr) و شاخص تفکیک (rp) در بین آغازگرهای مورد بررسی به ترتیب برابر 485/98، 361/0، 525/1 و 197/4 بود. در حالت کلی و بر اساس تمام شاخص‌ها، مناسب‌ترین آغازگر‌ها برای بررسی گونه مریم نخودی، آغازگرهای sc59 و sc11 تعیین شد. بیشترین تشابه را ژنوتیپ‌های (گیلان غرب2) با (ثلاث2) (0.732) و کمترین تشابه را ژنوتیپ (نفت شهر) با ژنوتیپ‌های (گیلان غرب1) و (گیلان غرب2) (0.10) داشت. گروه‌بندی حاصل از تجزیه کلاستر نشان داد که ژنوتیپ‌ها در 2 گروه قرار گرفته که نتایج حاصل از گروه‌بندی با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی (amova) و تجزیه به مولفه‌های اصلی (pcoa) تایید گردید.

Genetic variation study of Teucrium polium genotypes in the west of Iran using SCoT molecular markers

Teucrium polium L. is one of the well known medicinal and aromatic plants. In this study, we have used the SCoT marker to determine genetic variation among 17 genotypes of Teucrium polium collected from Kermanshah province, Iran. All of the SCoT primers showed 48 polymorphic bands. The primers of Sc20, Sc59 and Sc21 showed the highest number of band (6 bands) and Sc15 showed the lowest number of bands (2 bands). The mean polymorphic information content (PIC=0.361), marker index (MI= 1.525), Effective multiplex ratio (EMR= 4.197), polymorphism percentage (98.485%) and Resolving Power (RP=2.837) indices were calculated for all primers. The greatest similarity was between Gilan gharb2 and Salas2 stations with 0.732 values. The lowest genetic similarity was between Naft Shahr with Gilan gharb1 and Gilan gharb2 stations with 0.1. The cluster analysis group showed that the genotypes were classified into two groups, and the results of the clustering were confirmed by the use of molecular variance analysis (AMOVA) and principal components analysis (PCoA).