|
|
|
|
جداسازی ، همسانه‌سازی و آنالیزهای بیوانفورماتیکی زیر واحد i ژن سیتوکروم اکسیداز c در مرکبات
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عباسی علی ,غائب زمهریر مریم ,توحیدفر مسعود ,حسن زاده نادر
|
|
منبع
|
پژوهشهاي سلولي و ملكولي - 1398 - دوره : 32 - شماره : 4 - صفحه:469 -477
|
|
چکیده
|
سیتوکروم اکسیدازc، کمپلکس پروتئینی در غشاء داخلی میتوکندری یوکاریوت ها و غشاء پلاسمایی پروکاریوت های هوازی است که به عنوان آخرین آنزیم در چرخه انتقال الکترون به اکسیژن ایفای نقش می‌کند. سیتوکرم اکسیدازc در ساختار خود 3 زیر واحد (2،1 و 3) دارد. در این مطالعه زیر واحد 1 سیتوکروم سی اکسیداز متعلق به پرتقال citrus sciences بررسی شد. به این منظور پس از طراحی آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی‌های حاصل از مطالعه قبلی cdnaaflp بر روی گریپفروت، پرتقال، لیمو ترش، نارنگی و سلطان مرکبات، ژن مورد نظر با روش pcr تکثیر شد و در پلاسمید pgemt همسانه شد. انتخاب نوترکیب ها از طریق سیستم گزینش آبی سفید صورت گرفت. قطعات همسانه شده برای تایید نهایی توالی یابی شدند. بررسی نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی نشان داد که این ژن پروتئینی با وزن مولکولی23059.34 کیلودالتون را کد کرده و دارای 217 اسیدآمینه بوده و نقطه ایزوالکتریک آن 4.94 می‌باشد. هدف این مطالعه جداسازی و همسانه سازی ژن سیتوکروم اکسیدازاز ژنوم گیاه پرتقال و تعیین مشخصات آن است.
|
|
کلیدواژه
|
همسانه‌سازی، سیتوکروم c، ژنوم میتوکندری، پرتقال
|
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه بیماری شناسی گیاهی, ایران, سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور, بخش تحقیقات بیماریهای گیاهی, ایران, دانشگاه شهید بهشتی, دانشکده علوم زیستی و زیست فناوری, گروه بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه بیماری شناسی گیاهی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Isolation, cloning and bioinformatic analysis of cytochrom oxidase C subunit I in Citrus
|
|
|
|
|
Authors
|
Abasi Ali ,Tohidfar Masoud ,hasanzadeh nader
|
|
Abstract
|
Cytochrome oxidase is one of a superfamily of proteins which act as the terminal enzymes of respiratory chains. The two main classes are cytochrome c oxidases, and quinol oxidases. There are two catalytic subunits, I and II. Subunit I contains two heme centers. In this study we have isolated the cytochrom oxidase (COX) gene from orange by PCR and clone it by ligation of this product to pGEMT vector transformed E. coli bacteria. Sequencing analysis shows that open reading frame for this gene that encode a protein with 217 amino acids. Results of phylogenetic analysis showed that this gene in orange has related to Chondrostoma cytochrom oxidase gene (COX). cytochrom oxidase gene protein secrete in membrane and it’s extracellular secretion is little. The aim of this study was isolation and cloning of cytochrom oxidase gene genes from citrus genome and determining of it’s characterizations to practical use in the plants.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|