|
|
|
|
بررسی خصوصیات فیلوژنتیکی جمعیتهای زنبور عسل کوچک (apis florea) با استفاده از ژن‌های سیتوکروم اکسیداز i، ناحیه بین ژنی و سیتوکروم اکسیداز ii
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
نجف زاده داود ,ناظمی رفیع جواد ,رستم زاده جلال
|
|
منبع
|
پژوهشهاي سلولي و ملكولي - 1398 - دوره : 32 - شماره : 2 - صفحه:242 -254
|
|
چکیده
|
تعیین خصوصیات ژنتیکی موجودات زنده، اولین قدم برای اصلاح نژاد آ‌ن‌ها می‌باشد. این تحقیق در راستای مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیتهای زنبورعسل کوچکapis florea) ) در جنوب و جنوب غربی ایران انجام گرفت. به این منظور نمونهبرداری در مهرماه سال 1393 از چهار استان خوزستان (دزفول و آبادان)، بوشهر (بندردیلم و خورموج)، فارس (فیروزآباد و خرم‌بید) و هرمزگان (حمیران و بندرعباس) انجام شد. جهت بررسی خصوصیات ژنتیکی بخشی از ژن سیتوکروم‌اکسیداز i و ژن trnaleu، ناحیه بین ژنی و بخشی از ژن سیتوکروم‌اکسیداز ii مورد استفاده قرار گرفت. درخت فیلوژنی نواحی ژنی به روش‌های بیزی وحداکثر تشابه(mp) رسم گردید. پس از همردیفی توالی‌های هشت ناحیه نمونهبرداری شده از ایران مشخص گردید که بخشی از ژن سیتوکروم‌اکسیداز iو ناحیه بین ژنی (واقع در بین trnaleu و ژن سیتوکروم‌اکسیداز ii) به ترتیب دو و یک تفاوت تک نوکلئوتیدی (snp) در جمعیتهای مورد مطالعه داشتند. همچنین در این مطالعه، تفاوت نوکلئوتیدی بین توالی‌های trnaleu و ژن سیتوکروم‌اکسیداز ii توالی‌های هشت ناحیه نمونهبرداری شده از ایران مشاهده نشد. نتایج نشان داد که نمونه‌های مورد مطالعه در ایران براساس ژن سیتوکروم‌اکسیداز i به سه گروه تقسیم شدند که بر اساس آن نمونه‌های دیلم، فیروزآباد، آبادان و حمیران در گروه اول، نمونه‌های خورموج و بندرعباس در گروه دوم و نمونه‌های دزفول و خرم‌بید در گروه سوم قرار گرفتند. نتایج این مطالعه نشان داد که ژن سیتوکروم‌اکسیداز i در جمعیتهای زنبور عسل کوچک جنوب غربی و جنوب ایران تنوع ژنتیکی بیشتری داشت.
|
|
کلیدواژه
|
apis florea ,ناحیه بین ژنی، زنبورعسل کوچک
|
|
آدرس
|
دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه گیاه پزشکی, ایران, دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه گیاه پزشکی, ایران, دانشگاه کردستان, دانشکده کشاورزی, گروه علوم دامی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation of phylogenetic characteristics of dwarf honeybee populations (Apis florea) using COI, intergenic region and COII
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
Abstract
|
Determination of genetic characteristics of animates is the first step in breeding. This research was conducted for evaluation of genetic diversity of dwarf honeybee populations (Apis florea) in southwest and southern of Iran. The sampling was conducted in four provinces of Iran including Khozestan (Dezful and Abadan), Boshehr (Bndardeylm and Khormoj) Fars (Firoozabad and Khorrambid) and Hormozgan (Hamiran and Bandar Abbas). For studying of the genetic characteristics, partial COI, tRNAleu, intergenic region and partial COII were evaluated. Phylogenetic trees were drawn by Baysian and Maximum Parsimony (MP) methods. After sequence alignment, there was one and two single nucleotide polymorphism (SNP) in partial COI and intergenic region (situated between tRNAleu and COII) respectively in studied populations of Iran. Sequences of COI gene grouped the studied populations in three groups including Dylam, Firozabad, Abadan and Homeyran in the first group, Khormoj and Bandarabas in the second group and Dezfol and Khorambid in the third group. In addition, COI gene showed more genetic diversity in dwarf honeybee populations in southwest and southern areas of Iran.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|