ردیابی سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک شلغم (tumv) در علف هرز ناخنک (goldbachia laevigata) در مزارع زعفران

ویروس موزاییک شلغم (turnip mosaic virus; tumv) از خانواده پوتی ویریده و جنس پوتی ویروس، دارای وسیع‌ترین دامنه میزبانی در بین ویروس های این جنس است. علف‌های هرز به عنوان منابع نگهدارنده ویروس نقش مهمی در همه‌گیری آن روی گیاه اصلی دارند. به منظور ردیابی و بررسی حضور tumv، 44 گونه علف‌ هرز مربوط به هشت خانواده در بهار 1396 از مزارع زعفران شهرستان‌های قائن، فردوس، سرایان و بیرجند جمع‌آوری گردید. ردیابی اولیه ویروس در نمونه‌ها، با آزمون الایزا و rt-pcr با استفاده از آغازگرهای اختصاصی صورت گرفت و نمونه‌ای که در الایزا و pcr مثبت بود، تعیین توالی گردید. در بین 44 علف‌هرز، تنها نمونه مربوط به علف‌هرز ناخنک (goldbachia laevigata) در آزمون الایزا مثبت بود که در rtpcr نیز قطعه‌ای به طول 864 جفت باز مربوط به توالی کامل پروتئین‌ پوششی تکثیر نمود. در درخت تبارزایی حاصل از این جدایه (kho.ir) در مقایسه با 29 جدایه موجود در بانک جهانی ژن، چهار گروه تشکیل شد که جدایه ایرانی در گروه basal br قرار گرفت. بررسی یکسانی نوکلئوتیدی این جدایه با 29 جدایه بانک جهانی ژن، نشان داد که بیشترین تشابه بین جدایه مورد مطالعه با جدایه ایتالیا (ab093600) به میزبان 93/6 درصد و کمترین شباهت با جدایه‌ای از کانادا (d10927) برابر با 87/6 درصد می‌باشد. بنابر نتایج، علف هرز ناخنک به عنوان گیاه نگهدارنده tumv در مزارع زعفران معرفی گردید. تحقیق حاضر اولین بررسی سرولوژیکی و مولکولی tumv در علف‌های‌ هرز مزارع زعفران در ایران می‌باشد.

Serological and Molecular Detections of Turnip Mosaic Virus on Goldbachia laevigata in Saffron Fields

Turnip mosaic virus is a member of family Potyviridae, genus Potyvirus, have the widest host range in Potyviruses. Weeds are reservoir plants for viruses and have an important role in this epidemiology. In order to identify the wild hosts of TuMV in saffron fields, 44 samples were collected during April 2017 from Ghaen, Ferdows, Sarayan and Birjand cities of South Khorasan province. TuMV were detected by ELISA and RTPCR. Positive samples were sequenced and then analyzed by Phylogenetic software. Among 44 samples, Goldbachia laevigata was positive in ELISA and this isolate (KHo.IR) was amplified 864 bp of Coat protein gene using RTPCR. In phylogenetic tree of KHo.IR and 29 isolates of gene bank, four groups were formed that KHo.IR was in Group Basal BR. Homology matrix of KHo.IR and 29 gene bank isolates showed that the closest gene bank isolate was from Italy with 93.6% homologies and the furthest isolate was from Canada with 87.6% homologies. According to the results, Goldbachia laevigata serves as a reservoir plant of TuMV in saffron fields. This is the first survey of TuMV on weeds of Iranian saffron fields. Turnip mosaic virus is member of family Potyviridae, genus Potyvirus, have the widest host range in potyviruses. Weeds are reservoir plants of viruses and have an important role in epidemiology of viruses. In order to identify the wild hosts of TuMV in saffron fields, 44 samples were collected during April 2017 from Ghaen, Ferdows, sarayan and Birjand of South Khorasan provinces, TuMV were detected by ELISA and RTPCR, then positive sample were sequenced and analyzed by phylogenetic software. Among 44 samples of weeds, Goldbachia laevigata was positive in ELISA and this isolate (KHo.IR) was amplified 864 bp of Coat protein gene using RTPCR. In phylogenetic tree of KHo.IR and 29 isolates of gene bank, 4 groups were formed that KHo.IR was in Group Basal BR. Homology matrix of KHo.IR and 29 gene bank isolates showed that the closest gene bank isolate was from Italy with 93.6 % homologies and the furthest isolate was from Canada with 87.6 % homologies. According of the results of this study, : Goldbachia laevigata serves as a reservoir plant of TuMV in saffron fields. This is the first survey of TuMV on weeds of Saffron fields of Iran.