همسانه‌سازی و بررسی بیوانفورماتیکی ژن ccd1 در زعفران(crocus sativus l.) ایران

ایران بزرگترین تولیدکننده زعفران جهان می باشد بر همین اساس زعفران در کشور به عنوان یک محصول راهبردی محسوب می‌گردد. از آنجا که متابولیسم آپوکاروتنوئیدها عامل ارزش اقتصادی در گیاه زعفران است، لذا جداسازی و تجزیه و تحلیل شیمیایی ژن‌های درگیر در متابولیسم کاروتنوئیدها از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. باتوجه به اهمیت ژن در بیوسنتز آپوکاروتنوئیدها، در این تحقیق به منظور شناخت بیشتر از ساختار ژنومی زعفران ایران، به بررسی ویژگی‌های فیزیکی و شیمیایی این ژن پرداخته شد. همچنین روابط فیلوژنتیکی آنزیم توسط سرورها و نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی با هدف مطالعه پتانسیل ساختاری آن مورد پیش‌بینی قرار گرفت. ویژگی‌های فیزیکی و شیمیایی و فیزیولوژی پروتئین توسط سرورها و ابزارهای protparam ، sopma، protscale ، pfam ، protcomp ، signalp ، tmhmm ،، targetp و chlorop بررسی شدند. همچنین با استفاده از سرور ساختار سه‌بعدی پروتئین مورد بررسی قرار گرفت و جهت اعتبار سنجی ساختاری مدل ترسیم شده سه‌بعدی، پلات راماچاندران ترسیم گردید. نتایج تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنتیکی نشان داد که از لحاظ ساختار اسید آمینه‌ای، پروتئین بیشترین قرابت را با داشت. نتایج تجزیه و تحلیل ساختار پروتئین حاکی از فقدان وجود توالی راهنما و منطقه تراغشایی در آن بود و بطور کلی، نتایج نشان داد که پروتئین ، آنزیمی از خانواده کاروتنوئیداکسیژنازها و پایدار در شرایط آزمایشگاهی است. تجزیه و تحلیل‌های بیوانفورماتیکی انجام شده بر روی پروتئین زمینه را برای مطالعات عملکردی آینده فراهم می‌کند.