|
|
|
|
کاربرد تکنیک dna بارکدینگ و استفاده از نشانگرهای مولکولی در شناسایی کک ها
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
محمدی سعید ,لوترمن هایکا ,بنت نایجل ,ون وورن بتین
|
|
منبع
|
پلاسما و نشانگر هاي زيستي - 1400 - دوره : 14 - شماره : 4 - صفحه:129 -137
|
|
چکیده
|
زمینه و هدف: کک ها حشرات کوچکی از راسته سیفونپترا (siphonaptera)، بدون بال و بیضی شکل هستند که بدن آن ها در طرفین فشرده شده است. نقش آن ها در انتقال برخی از عوامل بیماری زا و ایجاد بیماری های زئونوز مانند طاعون و تیفوس آندمیک تایید شده است. با توجه به تنوع و نزدیک بودن ویژگی های ریخت شناسی، شناسایی دقیق گونه ها و زیرگونه های کک بر اساس مشخصات ریختی مشکل است. استفاده از نشانگرهای مولکولی و بارکدگذاری ژنتیکی با استفاده از یک یا چند بخش کوچک ازdna به عنوان بخش استاندارد شده ژنوم یک روش رده بندی مناسب جهت شناسایی گونه هاست. هدف از این مطالعه ارزیابی روابط فیلوژنتیکی چیاستوپسیلا گودفری با استفاده از تعیین‌توالی قسمتی از ژن سیتوکروم اکسیداز زیر واحد 1 (coi)، با استفاده از روش‌های زیست سنجی و مولکولی است.روش کار: این مطالعه در تمامی فصول سال 2017 در ذخیره گاه طبیعی telperian/ezemvelo واقع در استان خاتینگ آفریقای جنوبی انجام شد. به منظور صید جوندگان از تله های زنده گیر شرمن استفاده گردید. با استفاده از پنس تمامی کک های مستقر بر روی بدن میزبان جمع آوری و در الکل 70 درصد نگهداری و جهت انجام بررسی ریختی و مولکولی به آزمایشگاه منتقل شد.یافته ها: نتایج بررسی ریختی بین نمونه های جمع آوری شده نشان داد که دوریختی جنسی بین افراد نر و ماده این کک به استثنای متغیر طول بدن می باشد وجود ندارد (p<0.05). ترسیم درخت تبارزایی توالی ژن مورد مطالعه نشانگر تفاوت جزیی در افراد جمعیت مورد مطالعه می باشد.نتیجه گیری: بر اساس نتایج درخت فیلوژنی، با وجود اختلافات جزیی همه نمونه ها در یک کلاد قرار گرفتند. نتایج این مطالعه موید این است که توالی coiمی‌تواند در مطالعه تعیین و بررسی روابط تبارشناسی کک‌ها مورد استفاده قرار گیرد.
|
|
کلیدواژه
|
کک ها، سیتوکروم اکسیداز زیرواحد 1 (coi)، مورفولوژی، dna بارکدینگ
|
|
آدرس
|
دانشگاه پرتوریا, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه جانورشناسی و حشره شناسی, آفریقای جنوبی, دانشگاه پرتوریا, دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی, گروه جانورشناسی و حشره شناسی, آفریقای جنوبی, دانشگاه پرتوریا, دانشکده کشاورزی و منابع طبیع ی, گروه جانورشناسی و حشره شناسی, آفریقای جنوبی, دانشگاه ژوهانسبورگ, گروه جانورشناسی, آفریقای جنوبی
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
application of dna barcoding and use of molecular markers in the identification of fleas
|
|
|
|
|
Authors
|
mohammadi saeid ,loteman hica ,bent nijel ,van woren betin
|
|
Abstract
|
introduction objective: fleas are small insects of the order siphonaptera, wingless and oval, their bodies are compressed on both sides. their role in transmitting some pathogens and causing zoonotic diseases has been confirmed. using molecular markers and genetic barcoding using one or more small pieces of dna as a standardized part of the genome is a good classification method to identify species. the aim of this study was to evaluate the phylogenetic relationships of an endemic flea in south africa using sequencing of part of the cytochrome oxidase subunit 1 (coi) gene using morphometric and molecular methods.materials and methods: this study was conducted in 2017 in the telperian/ezemvelo nature reserve in south africa. sherman live traps were used to catch rodents. fleas were removed from their hosts using forceps, and mice were released at their point ofcapture within the same day. fleas were stored in 70% alcohol and transferred to the laboratory for morphological and molecular analysis.results: the results of morphological analysis of the collected samples showed that there is no sexual dimorphism between males and females of this species except for the body length variable (p <0.05). the phylogenetic tree showed a slight difference in the study population. despite minor differences, all specimens were placed in a clad.conclusion: the results of this study confirm that the coi sequences can be used to study the genealogical relationships of fleas.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|